ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ‌های سیاه‌شور مصری (hasselq.) zohary suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی scot

هدف: سیاه شور مصری با نام علمی suaeda aegyptiaca (hasselq.) zohary گیاهی هالوفیت است که کاربردهای تغذیه‌ای و دارویی زیادی دارد. نظر به اینکه تا‌کنون مطالعه‌ای در خصوص بررسی و تخمین تنوع ژنتیکی گیاه سیاه‌شور در استان خوزستان انجام نشده است، این مطالعه با هدف بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین ژنوتیپ‌های خودرو سیاه-شور در استان خوزستان طراحی و اجرا شد.مواد و روش‌ها: برای انجام مطالعات مولکولی از بین 71 نمونه جمع‌آوری شده 26 ژنوتیپ که دارای dna‌ی مناسب بودند و در دو ناحیه بیشترین پراکنش داشتند تحت عنوان گروه‌های یک و دو انتخاب شدند. جهت بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین و داخل ژنوتیپ‌ها از 12 آغازگر scot استفاده شد. بعد از استخراج dna و انجام pcr، امتیازبندی ژنوتیپ‌ها به صورت صفر (عدم نوار) و یک (وجود نوار) انجام شد و تعداد کل نوارها، تعداد نوارهای چندشکل، درصد نوارهای چندشکل، تعداد افراد دارای نوار، شاخص اطلاع دهی نوار، قدرت تفکیک، محتوای اطلاعات چندشکل، نسبت سهم موثر و شاخص نشانگر محاسبه شدند.نتایج: در مجموع 103 نوار تشکیل شد که درصد چندشکلی بالایی را نشان دادند. بیشترین میزان اطلاعات چندشکل (pic) متعلق به 14 scot (0.43) و 1 scot(0.33)، شاخص نشانگری(mi) متعلق به 14 scot (4.36) و بالاترین میزان قدرت تفکیک (rp) مربوط به 13scot (13.38) بود. مقادیر شاخص‌های تنوع ژنی نی (h)0.92، شانون (i) 0.320، شاخص تثبیت (fst) 0.092 و جریان ژنی (nm) 0.872 بدست آمدند. تجزیه خوشه ای به روش upgma ژنوتیپ‌ها را در پنج گروه قرار داد. در گروه اول 19 ژنوتیپ، در گروه دوم چهار ژنوتیپ و در سه گروه دیگر هرکدام یک ژنوتیپ قرار گرفتند. نتایج گروه‌بندی حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با تجزیه خوشه‌ای همخوانی داشته و گروه‌بندی تقریبا مشابهی را ارائه دادند. ژنوتیپ‌های kar2 ( کارون 2) و gh1 (غیزانیه) را که بیشترین فاصله ژنتیکی از هم داشتند، جهت ادامه برنامه‌های به‌نژادی مناسب می‌باشند. تجزیه واریانس مولکولی (amova) نشان داد که تنوع ژنتیکی درون گروه‌ها از بین گروه‌ها بیشتر بود.

evaluation of genetic diversity of suaeda aegyptiaca genotypes in khuzestan province using scot molecular markers

objectivesuaeda aegyptiaca (hasselq.) zohary is a halophyte plant with many nutritional and medicinal uses. there is no information on study and estimation of the genetic diversity of s. aegyptiaca plants in khuzestan province. so, this study was designed and implemented with the aim of investigating the genetic diversity and genetic relationships among s. aegyptiaca genotypes in khuzestan province. materials and methodsin order to study of genetic diversity and genetic relationships among s. aegyptiaca genotypes, 26 genotypes from two regions of khuzestan were selected as group one and two based on their dna quantity and quality from the 71 collected samples. 12 scot primers were used to investigate the diversity and genetic relationships among and within populations. genomic dna was extracted from leaf tissue of genotypes and dna amplification was done using 12 scot primers, the obtained bands were scored as zero (band absence) and 1 (band presence). total number of bands, number of polymorphic bands, and percentage of polymorphic bands, band information index, resolution power, polymorphic information content, marker index and shannon index were calculated.resultsa total of 103 fragments were amplified, which showed a high percentage of polymorphism. scot14 had the highest polymorphic information (0.43) and marker index (4.36). the highest resolution power (rp) belongs to scot13 (13.38). cluster analysis using upgma method classified the genotypes into five groups. karoun (kar2) and gheyzaniyeh (gh1) genotypes, with the highest genetic distance, were suitable for usage in breeding programs. analysis of molecular variance (amova) showed that genetic diversity within groups was higher than between groups. conclusionssome of the studied markers showed a high ability to distinguish genotypes, also the results indicated a high genetic diversity among the genotypes in terms of the studied scot markers. these results can be used in the breeding programs of s. aegyptiaca and related species.