|
|
انگشتنگاری dna در اکوتیپهای سه گونه گلختمی با استفاده از نشانگر مولکولی issr
|
|
|
|
|
نویسنده
|
ارجمند امین ,ابراهیمی محسن
|
منبع
|
بيوتكنولوژي كشاورزي - 1402 - دوره : 15 - شماره : 4 - صفحه:87 -104
|
چکیده
|
هدف: گلختمی گیاهی دارویی از خانواده پنیرکmalvaceae ) (و متعلق به جنس althaea میباشد. آگاهی از تنوعژنتیکی اساس بهنژادیگیاهی است و از جنبههای مختلف مانند انتخاب والدین تلاقی، حفاظت از ژرمپلاسم و جلوگیری از فرسایشژنتیکی دارای اهمیت است. هدف از انجام این تحقیق ارزیابی تنوعژنتیکی و بررسی روابطژنتیکی در اکوتیپهای بومی گلختمی ایران به منظور استفاده در پروژههای بهنژادی و حفاظت از ذخایرژنتیکی این گیاه بود.مواد و روشها: در این تحقیق پس از استخراج dna از برگهای جوان به روش ctab، تنوع مولکولی 18 اکوتیپ از سه گونه گلختمی (althaea sp.) با استفاده از 10 آغازگر issr مورد بررسی قرار گرفت.نتایج: میزان تعداد کل نوارهای تشکیل شده توسط آغازگرهای مورد مطالعه بین 11 تا 23 برای هر آغازگر متغیر و میانگین آن نیز 10/17 بود. تعداد نوارهای چندشکل در این تحقیق برای آغازگرها حداقل 7 و حداکثر 21 نوار بهدست آمد.در این تحقیق میزان pic بین 19/0 و 42/0 متغیر بود و میانگین آن نیز 29/0 بهدست آمد. بیشترین pic مربوط به آغازگرissr2 و کمترین pic نیز مربوط به آغازگرissr4 بود. تجزیهخوشهای نشان داد که در سطح تشابه 65 درصد اکوتیپهای مربوط به هر گونه در یک گروه و اکوتیپهای مربوط به گونههای متفاوت در گروههای مجزا قرار گرفت، به طوریکه اکوتویپهای قزوین، تفت، یزد، ساری، کرمان و شیراز که همگی متعلق به گونه althaea rosea بودند در یک گروه قرار گرفتند. در گروه دوم اکوتویپهای متعلق به گونه althaea ficifolia که شامل بهشهر، گرگان، بم، رفسنجان، همدان و مشهد بودند قرار گرفت . در گروه سوم نیز اکوتیپهای گونه althaea officinalis که شامل اکوتیپهای بشروئیه، کرمانشاه، اصفهان، جیرفت، فاریاب و بوشهر قرار گرفتند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 28 درصد از تنوع مربوط به درون گونهها و 72 درصد از تنوع مربوط به بین گونههای مورد مطالعه بود. نتایج تجزیه به مختصاتاصلی نیز نتایج حاصل از تجزیهخوشهای را تایید کرد.نتیجهگیری: با توجه به نتایج بهدست آمده نشانگر issr و آغازگرهای مورد بررسی در این آزمایش کارایی لازم را جهت تمایز اکوتیپ و گونههای گلختمی را دارا بودند و از طرفی با توجه به وجود تنوعژنتیکی از اکوتیپهای مورد مطالعه در این آزمایش میتوان به عنوان والدین در پروژههای بهنژادی این گیاه استفاده کرد و به منظور حفظ ژرمپلاسم و جلوگیری از فرسایش ژنتیکی، نگهداری اکوتویپ های مورد مطالعه در این تحقیق در بانک های ژن گیاهی پیشنهاد میگردد.
|
کلیدواژه
|
تجزیه خوشهای، تشابهژنتیکی، pic
|
آدرس
|
دانشگاه تهران, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاحنباتات, ایران, دانشگاه تهران, دانشکده کشاورزی, گروه علوم زراعی و اصلاحنباتات, ایران
|
پست الکترونیکی
|
mebrahimi@ut.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
dna fingerprinting in ecotypes of three marshmallow species using issr molecular marker
|
|
|
Authors
|
arjmand amin ,ebrahimi mohsen
|
Abstract
|
knowledge of genetic diversity is the basis of plant breeding and various aspects such as selection of cross parents, protection of germplasm and prevention of genetic erosion are important. the purpose of this research is to evaluate the genetic diversity and investigate the genetic relationships in the native ecotypes of marigold in iran in order to be used in breeding projects and to protect the genetic reserves of this plant. materials and methods: in this research, after extracting dna from young leaves by ctab method, the molecular diversity of 18 ecotypes of three species of marshmallow bud was investigated using 10 issr primers. results: the total number of bands formed by the primers studied in this research varied between 11 and 23 for each primer. the number of polymorphic bands in this research for the primers was at least 7 and at most 21 bands. in this research, the pic ranged between 0.19 and 0.42 and its average was 0.29. the highest pic was related to the issr2 marker and the lowest pic was related to the issr4 marker. cluster analysis showed that at the similarity level of 65%, the ecotypes related to each species were in one group and the ecotypes related to different species were placed in separate groups, so that the ecotypes of qazvin, taft, yazd, sari, kerman and shiraz which all of them belonged to the althaea rosea species and were placed in one group. in the second group, the ecotypes belonging to the althaea ficifolia species, which included behshahr, gorgan, bam, rafsanjan, hamadan and mashhad, were placed.the results of molecular variance analysis showed that 28% of the variation is within the species and 72% of the variation is among the studied species. the results of analysis to main coordinates also confirmed the results of cluster analysis. conclusion; according to the obtained results, the issr marker and the primers investigated in this experiment have the necessary efficiency to distinguish the ecotypes and the species of khatami flowers, and on the other hand, due to the genetic diversity of the ecotypes studied in this experiment, it can be the title of the parents was used in the breeding projects of this plant, and in order to preserve the germplasm and prevent genetic erosion, it is suggested to keep the ecotypes studied in this research in plant gene bank .
|
Keywords
|
cluster analysis ,genetic similarity ,pic
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|