|
|
بررسی بیان ژنهای bzip،mpk6 ،peroxidase72 ،murg ،lipoxigenase ،acc synthase و acc oxidase به عنوان ژنهای دخیل در مکانیسم مقاومت نخل خرما به کنه تارتن oligonychus afrasiaticus
|
|
|
|
|
نویسنده
|
کیانی لادن ,موسوی موسی ,سرخه کریم
|
منبع
|
بيوتكنولوژي كشاورزي - 1402 - دوره : 15 - شماره : 3 - صفحه:197 -220
|
چکیده
|
هدف: به منظور شناسایی ژنهای دخیل در مقاومت نخل خرما به کنه تارتن (oligonychus afrasiaticus)، جهت تعیین مکانیسم مولکولی مقاومت نخل خرما به کنه تارتن در این پژوهش بیان برخی از ژن های منتخب مورد بررسی قرار گرفت.مواد و روشها: از شش رقم خرما (سه رقم نسبتاٌ مقاوم و سه رقم حساس) موجود در پژوهشکده خرما و میوههای گرمسیری کشور، اهواز در اواخر تیرماه و همزمان با فعالیت کنه نمونهبرداری انجام شد. پس از استخراج rna و سنتز cdna، بیان هفت ژن شامل ژنهایbzip1 ،mpk6 ،peroxidase72 ، murg،lipoxigenase ، acc synthase و acc oxidase به روش qrt pcr بررسی شدند. جهت طراحی آغازگرها پس از بررسی نواحی کدکننده ژنهای منتخب (cds) و همترازی آنها با ژنوم خرما توسط clustal w با استفاده از پایگاههای primer3 و idt طراحی و ارزیابی نهایی شدند. پس از پایان آزمایش میزان نسبی رونوشت ژنها تعیین و با هم مقایسه شدند.نتایج: نتایج نشان داد که همه ژنهای منتخب به استثنای ژن mpk6 در ارقام زاهدی، حلاوی و استعمران دارای بیان بودند. ژن murg در ارقام مقاوم شامل زاهدی، حلاوی و استعمران، بیان بیشتری نسبت به ارقام حساس شامل لیلوئی، خضراوی و برحی نشان داد. بیان نسبی ژن peroxidase72 در ارقام نسبتا مقاوم شامل زاهدی (100%) و کمترین بیان نسبی ژن در رقم حساس لیلوئی (76/81%) بود. ژن bzip در ارقام نسبتاً مقاوم شامل زاهدی (100%) و کمترین بیان نسبی ژن در رقم حساس لیلوئی (76/83%) بود. ژن lipoxigenase در ارقام نسبتاً مقاوم شامل زاهدی (100%) و کمترین بیان نسبی ژن در رقم حساس لیلوئی (73/55%) بود. بیان نسبی ژن acc synthase در ارقام نسبتاً مقاوم شامل زاهدی (100%) و کمترین بیان نسبی ژن در رقم حساس لیلوئی (81/55 %) بود. ژن acc oxidase در ارقام نسبتاٌ مقاوم شامل حلاوی (100%) و کمترین بیان نسبی ژن در رقم حساس لیلوئی (37/85 %) بود. بیان ژن mpk6 در ارقام حساس مشاهده شد، امّا برای این ژن در ارقام نسبتاً مقاوم بیانی مشاهده نشد.نتیجهگیری: بیان برخی از ژنها در ارقام حساس و مقاوم از الگوی منظمی پیروی کرده و بیان ژنهای دیگر دارای الگوی نامنظمی بودند.بنابراین میتوان گفت که احتمالا نقش محصول ژنهای murg و bzip به صورت تنظیم مثبت القاء مقاومت نخل خرما نسبت به کنه است امّا نقش محصول ژن mpk6 به صورت تنظیم منفی القاء مقاومت به کنه در نخل خرما است. در مورد ژنهای peroxidase72 و acc oxidase الگوی ثابت بین ارقام حساس و بین ارقام نسبتاً مقاوم ملاحظه نشد.
|
کلیدواژه
|
بیان ژن، کنه تارتن، نخل خرما، oligonychus afrasiaticus
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه علوم باغبانی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه علوم باغبانی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
k.sorkheh@scu.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
investigating the expression of bzip, mpk6, peroxidase72, murg, lipoxigenase, acc synthase, and acc oxidase as genes involved in the resistance mechanism of date palm to oligonychus afrasiaticus
|
|
|
Authors
|
kiani kia ladan ,mousavi mousa ,sorkheh karim
|
Abstract
|
objective in order to identify the genes involved in the resistance of date palms to spider mite, sampling was taken from three relatively resistant and three susceptible date palm cultivars at the end of july in the kimmeri stage, simultaneously with mite activity. then the activity of some genes was investigated with the aim of determine the molecular mechanism of date palm resistance to the spider mite.materials and methodsafter rna extraction and cdna synthesis, the expression of 7 genes, including bzip, mpk6, peroxidase72, murg, lipoxigenase, acc synthase and acc oxidase genes, were investigated by qrt pcr in susceptible and semi resistant cultivars. in order to design the primers, the selected genes cds were aligning with the date palm genome and finding related genes by clustal w then primers were designed using primer3 databases. after the end of the experiment, the amount of gene transcripts were determined and compared.resultsthe murg gene showed higher expression in relatively resistant cultivars: zahedi, hallawi and estamaran than susceptible cultivars: lilwi, khadrawi and barhee (zahidi maximum and lilwi minimum). the expression of the peroxidase72 gene in relatively resistant cultivars including zahedi (100%) and the lowest expression related to susceptible cultivar lilwi (76.81%). the bzip gene was found in relatively resistant cultivars including zahedi (100%) and the lowest expression in the susceptible cultivar lilwi (78.19%). the lipoxigenase gene was found in relatively resistant cultivars including zahedi (100%) and the lowest expression in the susceptible cultivar lilwi (73.56%). the expression of the acc synthase gene in relatively resistant cultivars including zahedi (100%) and the lowest expression was in the susceptible cultivar lilwi (81.56%). the acc oxidase gene was in relatively resistant cultivars including hallawi (100%) and the lowest expression was in the susceptible lilwi cultivar (85.37%). mpk6 gene expression was observed in all three susceptible cultivars, but no expression was observed for this gene in all three relatively resistant cultivars.conclusionsthe expression of some genes in susceptible and resistant cultivars followed a regular pattern and the expression of other genes had an irregular pattern. as a result, it can be concluded that the role of murg and bzip gene product is up regulating the resistance of date palm to mite, but the role of mapk6 gene product is down regulating the resistance of date palm to mite.
|
Keywords
|
date palm ,gene expression ,spider mite ,oligonychus afrasiaticus
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|