بررسی تنوع ژنتیکی فوزاریوم‌های بخش elegans و martiella-ventricosum مرتبط با کدوییان با استفاده از نشانگرهای issr در استان تهران

هدف: هدف از این تحقیق شناسایی فوزاریوم‌های بخش‌های elegans و martiella-ventricosum مرتبط با گیاهان تیره کدوئیان در استان تهران و ارزیابی توانایی نشانگرهای issr در بررسی روابط خویشاوندی این گروه از فوزاریوم‌ها بود. مواد و روش‌ها: در این پژوهش تعداد پنج آغازگر (atg)6، (ac)8ya، (ag)8g، (ag)8c و bhb(ga)7 که بر اساس مطالعات محققین مختلف، در تمایز نژادهای مختلف فوزاریوم، کارایی خوبی از خود نشان‌داده ‌بودند، جهت انجام این آزمایش‌ها انتخاب شد. جدایه‌های قارچی پس از جداسازی و خالص‌سازی بر اساس خصوصیات ریخت‌شناسی و میکروسکوپی مورد شناسایی قرار گرفتند. جهت بررسی میزان کارایی نشانگرها در بروز چندشکلی، آماره‌های محتوای اطلاعات چندشکلی آغازگرها polymorphism information content (pic)، شاخص نشانگری  marker index (mi) و نسبت چندگانه موثرeffective multiplex ratio (emr)  محاسبه شد. روابط داخل گونه‌های fusarium با استفاده از نرم‌افزار ntsys-pc v2.02 و ضریب تشابه sm و ترسیم دندوگرام به‌روش upgma مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج: از مجموع 96 جدایه قارچی، تعداد 48 جدایه به‌عنوان fusarium solani، تعداد 25 جدایه به‌عنوان fusarium oxysporum و تعداد 23 جدایه به‌عنوان fusarium redolens تشخیص داده شدند. تمامی پنج آغازگر issr در طول آزمایشات pcr، باندهایی پایدار و قابل تکرار تولید کردند. از تکثیرهای issr مجموعاَ 408 باند به‌دست آمد. تعداد 130 نوع باند متفاوت تولید شد که از این تعداد، 83 باند پلی‌مورفیک و 47 باند مونومورفیک بود. . اندازه‌ی قطعات pcr تولید شده از 273 تا 2428 جفت‌باز متغیر بود. درصد چندشکلی به‌دست آمده از بیشترین (73 درصد) برای ubc-864 تا کمترین (56 درصد) برای ubc-808 متغیر بود. آغازگرهای (atg)6 و bhb(ga)7 در تفکیک بخش‌های elegans و martiella-ventricosum از همدیگر عملکرد بهتری داشتند. آغازگر ubc-808 ((ag)8c) با تولید 26 جایگاه ژنی بیشترین تولید باند را در جدایه‌های بخش elegans و آغازگر ubc-885 (bhb(ga)7) با تولید 25 باند بیشترین تولید باند را در مورد جدایه‌های بخش martiella-ventricosum داشت. نتیجه‌گیری: نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگر issr یک نشانگر کارآمد جهت آشکارسازی روابط مولکولی بین توده‌ها و جدایه‌های قارچ فوزاریوم می‌باشد.

investigation of genetic diversity in fusarium of elegans and martiella-ventricosum sections related to cucurbits using issr markers in tehran province

objectivethis research aimed to identify fusariums belonging to elegans and martiella-ventricosum sections related to cucurbit plants in tehran province and to evaluate the ability of issr markers to investigate the kinship relationships of these groups of fusariums. materials and methodsin this research, five issr primers (ag)8c, (ag)8g, (ac)8ya, (atg)6 and bhb(ga)7 were selected. fungal isolates identified based on morphological and microscopic characteristics. for issr markers, the statistics of polymorphism information content (pic), marker index (mi) and effective multiplex ratio (emr) were calculated. relationships and similarity between fusarium isolates were analyzed using ntsys-pc v2.02. resultsout of 96 fusarium isolates, 48 isolates were identified as fusarium solani, 25 isolates as fusarium oxysporum and 23 isolates as fusarium redolens. a total of 408 bands were obtained from issr amplifications. 130 different bands were produced, of which 83 were polymorphic and 47 were monomorphic. the size of pcr fragments produced varied from 273 to 2428 bp. the polymorphism percentage, ranged from the highest (73%) for (atg)6 to the lowest (56%) for (ag)8c. primers (atg)6 and bhb(ga)7 performed better in differentiation elegans and martiella-ventricosum sections from each other. primers (ag)8c with 26 gene loci, and bhb(ga)7 with 25 gene loci, produced the most bands in elegans isolates and martiella-ventricosum isolates, respectively. conclusionsthe results of this research showed that there was a high genetic diversity among the investigated fusarium isolates and that the issr markers are efficient markers to reveal the molecular relationships between fusarium populations.