ارزیابی روابط ژنتیکی گونه‌های آژیلوپس با استفاده نشانگرهای چندشکلی نواحی هدفمند (trap)

هدف: هدف این تحقیق تعیین روابط و سطح تنوع ژنتیکی بین و درون گونه های وحشی آژیلوپس با استفاده از نشانگرهای ملکولی trap که مبتنی بر نواحی est هستند،  می باشد.مواد و روش‌ها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی و روابط بین گونه های وحشی آژیلوپس جمع آوری شده از 14 استان ایران متشکل از هشت گونه aegilops   با استفاده از 24 ترکیب آغازگرهای trap مورد ارزیابی قرار گرفتند.نتایج: میانگین pic  آغازگرهای مورد مطالعه برابر 95/0 و کمترین و بیشرین میزان این شاخص به ترتیب مربوط به آغازگرهای (92/0) trap20 و (97/0) trap10  بود. همچنین میانگین شاخص نشانگری (mi) برابر 77/10 و کمترین و بیشرین میزان این شاخص به ترتیب مربوط به آغازگرهای (95/6) trap3 و (34/17) trap17  بود. نتایج تجزیه واریانس ملکولی، واریانس بین گونه ها را 60 و واریانس درون گونه ها را 40 درصد نشان داد. پارامترهای ژنتیکی برآورد شده نشان داد که بیشترین میزان na (07/1)، ne (26/1)، i (23/0) و uhe (16/0) مربوط به گونه ae. truncialis  و حداکثر شاخص تنوع ژنی نی (14/0) مربوط به گونه های ae. truncialis، ae. umbelulata و ae. neglecta  بود. حداقل مقدار شاخص های تنوع ژنی نی (09/0)، شاخص شانون (14/0)، تعداد آلل موثر (16/1) و تعداد آلل مشاهده شده (79/0) برای گونه ae. crassa مشاهده شد. کمترین تشابه ژنتیکی  بین ae. crassa با گونه های ae. cylandrica  و ae. umbelulata و بیشترین تشابه بین ae. triuncialis و ae. umbelulata مشاهده شد.  قرار گرفتن ae. umbelulata و ae. truncialis در یک گروه در تجزیه خوشه ای و تجزیه به مختصات اصلی و با فاصله زیاد از سایر گونه ها شباهت ژنتیکی بالای این دو گونه را تائید کرد.نتیجه‌گیری: نتایج تحقیق تنوع ژنتیکی بالایی را در بین و درون گونه ها نشان داد. تجزیه واریانس ملکولی تنوع ژنتیکی بالاتر در بین گونه ها را مشخص کرد که این نتیجه نمایانگر جریان ژنی و شاخص تثبیت (fst) پایین در بین گونه ها و نیز تایید کننده تمایز ژنتیکی بالا در بین گونه ها بود.

Evaluation of genetic relationships of Aegilops species with targeted region amplified polymorphism (TRAP) markers

ObjectiveThe aim of this study was to determine the relationships and genetic diversity between and within wild species of Aegilops using ESTderived TRAP molecular markers. Materials and MethodsIn this study, genetic diversity and relationships among eight wild species of Aegilops collected from 14 provinces of Iran were evaluated using 24 TRAP primer combinations. ResultsThe mean of PIC for studied primers was 0.95 and the lowest and highest values ​​of this index were related to TRAP20 (0.92) and TRAP10 (0.97), respectively. Also, the mean of MI was 10.77 and the lowest and highest values ​​were related to TRAP3 (6.95) and TRAP17 (17.34), respectively. The molecular analysis of variance showed 60% variance between species and 40% variance within species. Estimated genetic parameters showed that the highest levels of Na (1.07), Ne (1.26), I (0.23) and uHe (0.16) belonged to Ae. truncialis and the maximum Nei gene diversity (0.14) was related to Ae truncialis, Ae. umbelulata and Ae. neglecta. Minimum values ​​of Nei gene diversity (0.09), Shannon index (0.14), No. of effective alleles (1.16) and No. of observed alleles (0.79) was observed for Ae. crassa. The least genetic similarity was observed between Ae. crassa with Ae. cylandrica and Ae. umbelulata and the most similarity between Ae. triuncialis and Ae. umbelulata. Being in the same group of Ae. umbelulata and Ae. truncialis with cluster analysis and PCOA confirmed the high genetic similarity of these species. ConclusionsThe results showed high genetic diversity among and within species. Molecular analysis of variance revealed higher genetic diversity between species, indicating low gene flow and Fst, as well as a high genetic differentiation between species.