شناسایی واریانت‌های ژنتیکی در لاین‌آرین و بررسی عملکرد آنها با استفاده از توالی‌یابی‌کل ژنوم

مطالعه حاضر، اولین پژوهش برای شناسایی واریانت‌های ژنتیکی در لاین‌ آرین با اطلاعات توالی‌یابی کل ژنوم است. مطالعه خصوصیات لاین‌ آرین در سطح ژنوم، می‌تواند تفاوت‌های ژنتیکی آن را در ارتباط صفات مهم اقتصادی از جمله رشد شرح دهد. در این پژوهش، از اطلاعات توالی کل ژنوم سه قطعه مرغ آرین استفاده شد. نتایج نشان داد که 63866 واریانت بین نمونه‌ها مشترک است که از این تعداد، 17604 واریانت به عنوان واریانت جدید برای اولین بار در این پژوهش گزارش شدند. همچنین، 604 واریانت در مناطق کدکننده ژنوم وجود دارند که از این تعداد، 204 واریانت منجر به تغییر در نوع آمینواسیدی پروتئین‌ها می‌گردند. با توجه به مهم بودن کیفیت پروتئین جیره برای رشد و افزایش وزن برای طیور، نتایج ژن آنتولوژی نشان داد که مسیر کاتابولیسم پروتئین‌ها و مسیرهای تغییرات پس از ترجمه‌ی پروتئین‌های مرتبط با رشد دارای اهمیتی دوچندان هستند. همچنین، ژن‌های کاندیدایsmurf2 و sumo1 برای این مسیرهای بیولوژیک پیشنهاد شد. یکی دیگر از نتایج قابل توجه ژن آنتولوژی، معنی‌دار شدن مسیرهای پاسخ به تنش بود. در لاین آرین به دلیل انتخاب شدید برای دستیابی به پیشرفت ژنتیکی بالا در صفات رشد، وجود تنش اجتناب‌ناپذیر است. بنابراین، معنی‌دار شدن مسیرهای پاسخ به تنش، می‌تواند نشان دهنده اهمیت این مسیرها در ارتباط با عملکرد مطلوب باشد.