شناسایی snpها در نواحی اگزونی ژن‌های اوژنول o-متیل ترنسفراز و چاویکول o-متیل ترنسفراز در گیاه ریحان

به منظور شناسایی تنوع‌های تک نوکلئوتیدی single nucleotide polymorphism)) در ژن‌های اوژنول o-متیل ترنسفراز (eomt) و چاویکول o-متیل ترنسفراز (cvomt) در توده‌های مختلف ریحان از نشانگرهای caps (cleaved amplified polymorphic sequences) و توالی‌یابی استفاده شد. قطعاتی با اندازه 571 و 908 جفت باز از نواحی کد کننده این دو ژن‌ تکثیر و با آنزیم‌‌های برشی pst1 و msei هضم شد. آنزیم pst1 در ژن eomt دو قطعه با اندازه‌های480 و 91 جفت باز و در ژن cvomt قطعاتی با اندازه‌های 621 و 287 جفت باز تولید می کند. برش قطعات تکثیری هر دو ژن با آنزیم pst1 الگوهای مشابهی در 80 فرد تولید کرد. آنزیم msei در این دو ژن به ترتیب قطعاتی با اندازه‌های 59، 135 و 377 جفت باز و 275، 302 و 331 جفت باز تولید می کند. برش قطعات تکثیر شده هر دو ژن با این آنزیم در افراد مورد مطالعه الگوهای برشی متنوعی تولید کرد. از هر نوع الگوی برشی یک نمونه انتخاب و توالی‌یابی شد. توالی‌ها با استفاده از نرم افزار clustal omega هم ردیف و snp‌ها در هر کدام از ژن ها شناسایی شدند. نتایج همردیفی نشان داد جهش های همجنس t<->c و a<->g در ژن eomt مشاهده می شود ولی جهش های ناهمجنس در این ژن مشاهده نشد. در ژن cvomt تبدیل بازهای a<->g، t<->c، a<->c و a<->t شناسایی گردید که بیشترین جهش مربوط به تبدیل بازهای a<->g بود. به‌طورکلی نتایج این تحقیق نشان داد که چندشکلی در نواحی اگزونی ژن‌های مورد مطالعه کم بوده و نواحی کد کننده این ژنها در طول تکامل ریحان محفوظ بوده است.