مقایسه توالی ژن DBAT، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، در گونه‮های سرخدار و قارچ های اندوفیت

هدف: هدف از این تحقیق، بررسی حضور ژن dbat، یکی از ژن­های کلیدی در مسیر بیوسنتزی تاکسول، در سرخدار (taxus baccata) و قارچ اندوفیت مولد تاکسول آن و نیز بررسی میزان شباهت این توالی­ها با توالی­های موجود در بانک ژن بود.مواد و روش­ها: در این تحقیق، قارچ­های اندوفیت از پوست درخت سرخدار جداسازی و به روش نوک هیف خالص­سازی شدند. dna ژنومی درخت سرخدار و یکی از قارچ­های مولد تاکسول (ایزوله t9) استخراج گردید. حضور ژن dbat به‏وسیله واکنش زنجیره‏ای پلیمراز بررسی گردید. پس از توالی­یابی، میزان شباهت توالی­های به‏دست آمده از سرخدار و ایزوله t9 با توالی­های سایر گونه­های سرخدار و قارچ‏های اندوفیت، موجود در پایگاه بانک ژن، مقایسه شدند.نتایج: با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، یک قطعه bp 125 از ژن dbat سرخدار و ایزوله t9 تکثیر گردید. هم‏ردیفی توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی قارچ و گیاه میزبان نشان داد که این توالی­ها دارای شباهت بسیار بالایی (بیش از 98درصد) بودند. نتایج هم‏ردیفی این توالی­ها با توالی­های گونه­های دیگر سرخدار و قارچ­های اندوفیت، نیز شباهت بسیار بالایی (98 تا100 درصد) را نشان داد. همچنین، شباهت نسبتا بالایی در توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی آنزیم dbat و سایر آنزیم‏های آسیل و آروئیل ترانسفراز درگیر در مسیر بیوسنتزی تاکسول مشاهده شد.نتیجه­گیری: براساس نتایج، حضور ژن dbat در قارچ اندوفیت مولد تاکسول جداشده از سرخدار و همچنین شباهت بسیار بالا آن، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، با توالی بدست آمده از ژن dbat میزبان (taxus baccata) و توالی گونه­های دیگر سرخدار و نیز قارچ­های اندوفیت به اثبات رسید