مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه های بالینی مایکوباکتریوم فورچوییتوم بر اساس تکنیک RAPD-PCR

سابقه و هدف: امروزه مایکوباکتریوم های غیرتوبرکلوزی (ntm)، به دلیل افزایش شیوع بیماری زایی و ظهور مقاومت های آنتی بیوتیکی اهمیت فراوان یافته اند. رایج ترین مایکوباکتریوم غیرسلی در ایران ، مایکوباکتریوم فورچوییتوم می باشد. این مطالعه با هدف شناسایی مولکولی و بررسی تنوع ژنتیکی در میان جدایه های بالینی مایکوباکتریوم فورچوییتوم در ایران با استفاده از روش rapd-pcr انجام شد. مواد و روش ها: این مطالعه به صورت مقطعی- توصیفی بر روی 81 ایزوله ntm جداسازی شده از نمونه های مختلف بالینی انجام شد. به منظور شناسایی اولیه مایکوباکتریوم فورچوییتوم از رنگ آمیزی اسیدفست و تست های رایج بیوشیمیایی استفاده گردید. جدایه ها با روش pcr تایید شدند و محصولات pcr به وسیله 3 آنزیم برش دهنده avaii، hphi وhpaii هضم گردیدند. در نهایت تیپ بندی مولکولی جدایه های مایکوباکتریوم فورچوییتوم به کمک آنالیز rapd انجام شد.یافته ها: از مجموع 81 ایزوله ntm بررسی شده، 36 سویه به عنوان مایکوباکتریوم فورچوییتوم شناسایی شدند. این سویه ها بر اساس پرایمرهای rapd در 10 خوشه اصلی قرار گرفتند. بیشتر جدایه ها در رپید تایپ 1 (9 عضو ، 25%)، 2 (8 عضو ، 2/22%) و 6 (6 عضو ، 6/16%) طبقه بندی شدند. در آنالیز رپید، قطعه اصلی 300 جفت بازی (4/94%) و پس از آن قطعه 1000 جفت بازی (6/66%) وجود داشت.نتیجه گیری: نتایج مطالعه حاضر، قدرت تمایزی بالای rapd-pcr را نشان می دهد. این آنالیز می تواند تنوع ژنتیکی و اطلاعات اپیدمیولوژیکی را در مورد جدایه های مایکوباکتریوم فورچوییتوم ارایه دهد. آنالیز rapd ساده، سریع، ارزان و پیچیدگی کمتری نسبت به سایر روش های تیپ بندی مولکولی دارد.