ساختار جمعیت باکتریایی رسوبات نمکی تالاب پرشور جنوب تپه های حلقه دره استان البرز

سابقه وهدف: بررسی ساختار جمعیت باکتریایی زیست بوم های پرشور و شناسایی گونه های جدید هالوفیل می تواند از نظر زیست فناوری و اکولوژی حائز اهمیت باشد. این تحقیق با هدف بررسی ساختار جمعیت باکتریایی رسوبات تالاب نمکی جنوب تپه های حلقه دره انجام شد.مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی با نمونه برداری از تالاب نمکی جنوب حلقه دره در خرداد 97 انجام شد. جداسازی باکتری های هتروتروف با استفاده از محیط کشت r2a آگار انجام شد. پس از تفکیک جدایه ها بر اساس خصوصیات مورفولوژیک و بیوشیمیایی، تعیین هویت و ارتباطات فیلوژنتیک جدایه های منتخب با توالی یابی ژن 16s rrna و بر اساس اطلاعات موجود در بانک ژنی ncbi و توسط نرم افزار های بیوانفورماتیک انجام شد. همچنین از توالی یابی نسل جدید ایلومینا به عنوان روش غیر وابسته به کشت به منظور بررسی تنوع باکتریایی استفاده شد.یافته ها: جدایه ها شامل 13 گونه در 8 جنس باسیلوس (31.25)، هالوموناس(25%)، گراسیلی‏باسیلوس (12.50%)، ویرجی باسیلوس (6.25%)، استرپتومایسس (6.25%)، نیتراتی‏رداکتر(6.25%)، استافیلوکوکوس(6.25%)و پلانوکوکوس (6.25) بودند. همچنین نتایج ایلومینا حاکی از غالبیت گونه های آنورینی‏باسیلوس میگولانس و پانی‏باسیلوس پلی‏میکسا بود.نتیجه گیری: نتایج نشان داد که جمعیت میکروبی تالاب مورد مطالعه با سایر تالاب های پرشور گزارش شده در سایر نقاط دنیا مشابه است و بیشتر جدایه ها مربوط به گونه های هالوتولرانت و هالوفیل بودند. حضور گونه های متنوع می تواند نشان دهنده  وجود گروه های جدید تاکسونومیک و غنای بالای ژنی در این اکوسیستم پرشور باشد که می تواند در پژوهش های تکمیلی مورد بهره برداری قرار گیرد.

Bacterial community structure in saline sediments from hypersaline wetland in south of Halghe Dare hills, Alborz province

Background Objectives: Survey of bacterial community structure in hypersaline ecosystems and identification of novel halophilic species can be very important from biotechnological and ecological aspects. In this study, we survey bacterial community structure in sediments from saline wetland in south of Halghe Dare hills as one of the hypersaline ecosystems in Alborz province. Materials Methods: This cross-sectional study was performed by sampling from saline wetland in south of Halghe Dare hills in June 2018. Isolation of heterotrophic bacteria was conducted using R2A agar medium. After differentiation of isolates based on morphological and biochemical characteristics, identification and phylogenetic relationships analysis of selected isolates were performed by 16S rRNA gene sequencing and analysis using NCBI databases and bioinformatics softwares. The Illumina next-generation sequencing was also applied to survey bacterial diversity by cultivation-independent method. Results: Isolates included 13 species belonging to 8 genera including Bacillus (31.25%), Halomonas 25%, Gracilibacillus (12.50%), Virgibacillus (6.25%), Streptomyces (6.25%), Nitratireductor (6.25%), staphylococcus (6.25%) and Planococcus (6.25%). Illumina sequencing showed that Aneurinibacillus migulanus and Paenibacillus polymyxa were dominant species insoil sample. Conclusion: The results showed that the microbial population of the studied wetland is similar to the community of the wetlands reported in other parts of the world and dominated by halotolerant and halophilic species. Presence of various bacterial species and some probable novel taxonomic groups in saline wetland in south of Halghe Dare hills presents a new genetic and microbial source for future studies.