تنوع ژنتیکی ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی و سفیدبالک ناقل آن بمیزیا تاباسی در منطقه سیستان

ویروس پالامپور پیچیدگی برگ گوجه فرنگی از بیماری‌های مهم ویروسی است که از برخی از مناطق کشور گزارش شده است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی جدایه‌های این ویروس از منطقه سیستان و سفیدبالک ناقل آن بیمیزیا تاباسی با استفاده از تعیین ترادف بخشی از ژنوم آن‌ها تجزیه و تحلیل شد. برگ بوته‌های دارای علائم این ویروس و حشرات بالغ بیمیزیا تاباسی از شهرستان‌های منطقه سیستان در فصل پاییز 1398 جمع‌آوری شدند. ردیابی ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن پروتئین پوششی در سه محصول خربزه، بادمجان و فلفل انجام شد. ترادف‌های نوکلئوتیدی ژن پروتین پوششی سه جدایه این ویروس از منطقه سیستان که از خربزه، بادمجان و فلفل جدا شده بودند یکسانی نوکلئوتیدی 99-92 درصد را با سایر جدایه‌های ویرس که قبلاً گزارش شده بودند نشان دادند. درخت تبارزایی ترسیم شده براساس ترادف ژن پروتئین پوششی نشان داد که جدایه‌های منطقه سیستان با جدایه‌های ایرانی گروه‌بندی می‌شوند. بادمجان و فلفل میزبان‌های جدیدی برای ویروس در ایران بودند. تجزیه و تحلیل تبارزایی بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ژن زیر واحد شمارة 1 سیتوکروم اکسیداز میتوکندریایی نشان داد که نمونه‌های بیمیزیا تاباسی جمع‌آوری شده از منطقه سیستان به همراه سایر نمونه‌های بیمیزیا تاباسی ایرانی در گروه بیوتیپb قرار می‌گیرند. نمونه‌های سفید بالک شهرستان‌های زابل، زهک و هیرمند به ترتیب دارای یکسانی نوکلئوتیدی 100، 97.75 و 99.68 درصد با برخی از نمونه‌های سفید بالک استان فارس بودند. در این تحقیق جدایه‌های ویروس از منطقه سیستان با جدایه‌های ایرانی گروه‌بندی شدند و نمونه‌های بیمیزیا تاباسی جمع‌آوری شده از منطقه سیستان متعلق به بیوتیپ b بودند.

Genetic diversity of Tomato leaf curl Palampur virus and its whitefly vector, Bemisia tabaci, in the Sistan region

Background Objectives: Tomato leaf curl Palampurvirus (ToLCPMV) is one of the most important plant viruses that has been reported from some regions of Iran. In this study, we analysed the genetic diversity of Sistanian isolates of ToLCPMV and their vector, Bemisia tabaci by partial genome sequencing. Materials Methods: Leaves of plants expressing symptoms of ToLCPMV infection and B. tabaci adults were collected from cities of the Sistan region during the autumn season of 2019. Specific primers of gene coat protein were used to detect ToLCPMV in three crops (melon, eggplant and pepper). Results: Nucleotide sequences of coat protein gene of three Sistanain isolates of ToLCPMV showed 92-99 % sequence identity with previously characterized ToLCPMV isolates. Phylogenetic analyses based on nucleotide sequences of coat protein gene indicated that in the Sistanian isolates of ToLCPMV grouped with other Iranian isolates. Eggplant and pepper represent new natural hosts of ToLCPMV in Iran. Phylogenetic analysis based on mitochondrial cytochrome oxidase-I gene sequences showed that the collected B. tabaci samples from the Sistan region and other Iranian B. tabaci samples belong to the B biotype. Bemisia tabaci samplesof Zabol, Zahak and Helmand counties showed respectively 100, 97.75 and 99.68% nucleotide sequence identity to some from Fars province samples of B. tabaci. Conclusion: In this study, the Sistanain isolates of ToLCPMV were grouped with Iranian isolates of ToLCPMV and the collected B. tabaci samples from the Sistan region belong to the B biotype.