|
|
|
|
آنالیز منحنی ذوب با شفافیت بالا(hrm) به منظور شناسایی سریع و دقیق باکتری سالمونلا بااستفاده از ژن inva
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
سعید ابادی محمد صادق ,نیلی حسن ,قرشی علی ,دادرس حبیب الله
|
|
منبع
|
دنياي ميكروب ها - 1399 - دوره : 13 - شماره : 2 - صفحه:130 -137
|
|
چکیده
|
سابقه و هدف: سالمونلوز یکی از بیماری های عفونی و مشترک بین انسان و حیوانات است که به وسیله سویه های مختلف سالمونلا ایجاد می گردد. پیشرفت در روش های تشخیص مولکولی، شناسایی پاتوژن های غذایی را دقیق تر و راحت کرده است. هدف از این پژوهش استفاده از روش hrm به منظور شناسایی سریع و دقیق باکتری سالمونلا با استفاده از ژن inv a می باشد. مواد و روش ها: در این تحقیق شناسایی باکتری سالمونلا با واکنش زنجیره ای پلی مراز با روش منحنی ذوب با شفافیت بالا ( pcr-hrm) به وسیله توالی ژن inva، به عنوان یک نشانگرانجام شد.در مجموع تعداد 9 سویه رفرانس سالمونلا با استفاده از یک جفت آغازگراختصاصی ژن inva برای تشخیص باکتری سالمونلا استفاده شدند. یافته ها: قطعات موردانتظار 284 جفت بازی پس از تکثیر ژنinva توسط pcr به دست آمد. تمام نمونه های مورد آزمون قادر به تولید پیک منحنی ذوب اختصاصی سالمونلا با شفافیت بالا در بازه دمایی 87/8 تا 87/9 درجه سلسیوس بودند.نتیجه گیری:نتایج نشان داد که روش شفافیت منحنی ذوب با استفاده از آغازگر های اختصاصی ژن inva می تواند به عنوان یک روش دقیق و مطمئن به منظور تعیین جنس های سالمونلا مورد استفاده قرار گیرد.
|
|
کلیدواژه
|
ژن inva، بیماری عفونی، روش جدید تشخیص
|
|
آدرس
|
سازمان تحقیقات و آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی, بخش تحقیقات بیماریهای طیور, ایران, دانشگاه شیراز, دانشکده دامپزشکی, گروه علوم درمانگاهی, ایران, دانشگاه چارلز استارت, دانشکده علوم دام و دامپزشکی, گروه میکروبیولوژی, استرالیا, دانشگاه شیراز, دانشکده دامپزشکی, گروه علوم درمانگاهی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
dadras@shirazu.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
High resolution melting (HRM) curve analysis for rapidly and accurate determination of Salmonella spp. with invA gene
|
|
|
|
|
Authors
|
Saeiabadi mohammad Sadegh ,Nili hasan ,ghorashi ali ,Dadras Habibollah
|
|
Abstract
|
Background Objectives: Salmonellosis is an infectious and common disease between humans and animals that is caused by different strains of Salmonella. Progress in molecular diagnostic methods, has led to accurate and easy detection and characterization of food microbial agent. The purpose of this research was to use HRM technique to access more accurate and rapid diagnosis of Salmonella bacteria by means of invA gene. Material Methods: In this study, diagnosis of Salmonella was done by polymerase chain reaction and high resolution melting curve ( PCR-HRM) using the sequence on invasion A gene (invA) as a marker. In total 9 Salmonella reference strains using a specific primer pair of genes invA were used to detect Salmonella. Results: The expected size of PCR amplified fragments of invA gene was determined as 284bp. All tested strains were able to show a Salmonella specific melting curve with high resolution at thermal interval of 87.8-87.9°C. Conclusion: The results showed that HRM using specific primers of invA gene can be used as an accurate and reliable technique for diagnosis Genus of Salmonella.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|