تایپینگ مولکولی اشریشیاکلی تولید کننده بتالاکتاماز: مقایسهmlva و pfge

سابقه و هدف: اشریشیا کلی تولید کننده بتالاکتاماز مهمترین عامل ایجاد کننده عفونت‌های دستگاه ادراری در جامعه و بیمارستان‌ها است. روش‌های تعیین  تایپ سویه‌ها مانند mlva و pfge معمول‌ترین ابزار اپیدمیولوژیک نه تنها برای تشخیص انتقال متقاطع پاتوژن‌های بیمارستانی بلکه برای تعیین منبع عفونت می‌باشند.مواد و روشها: این پژوهش به به منظور ارزیابی قدرت تمیز روش‌های mlva و pfge انجام شد. در مجموع 230 جدایه  اشریشیا کلی بدست آمده از بیماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراری از نظر حساسیت ضد میکروبی آزمایش و به منظور مقایسه mlva و pfge برای تایپ مولکولی جدایه‌ها مورد بررسی قرار گرفتند.یافته ها: از 230 جدایه، 130 جدایه اشریشیا کلی تولید کننده بتالاکتاماز (56/5%) در این مطالعه یافت شد. شاخص تنوع لوکوس‌های vntr به ترتیب برای روش 7 و 10 لوکوسی 0/48 و 0/54 تعیین شدند. قدرت تمیز pfge 0/87 محاسبه گردید.نتیجه گیری: نتایج نشان داد که قدرت تمیز pfge بیشتر از mvla است. mlva روشی مبتنی بر pcr است و برخلاف pfge، داده‌های غیرقابل اشتباه تولید می‌کند. بهینه سازی vntr پلی مورفیک برای بهبود قدرت تمیز mlva در هر منطقه جغرافیایی ضروری است.

Molecular typing of β -lactamase -producing Escherichia coli: Multiple Locus variable number tandem repeat analysis Versus Pulsed-field gel electrophoresis

Background Objectives: β -lactamase -producing E. coli is the most important agent causing   urinary tract infections both in community and hospitals. Strain typing including MLVA and PFGE are the most common epidemiologically   tools not only for detecting the cross transmission of nosocomial pathogens but also for determining the source of infection.Materials and methods: The present study was carried of for comparison of discriminatory power of MLVA and PFGE methods. A Total of 230 isolates of E. coli from patients with urinary tract infections were examined for identifying and antimicrobial susceptibility testing MLVA and PFGE methods were used for molecular typing of all isolates.Results: Out of 230 isolates, 130 ( 56.5%) β -lactamase -producing E. coli isolates were found in this study. The diversity indices of the VNTR loci showed an average diversity of 0.48 and 0.54 for 7-loci and 10-loci respectively. The discriminatory power of PFGE showed a value of 0.87. Conclusion: Our study showed that PFGE is more discriminatory than MVLA. MLVA is a     PCR- based method and generates unmistakable data, in contrast to PFGE. Optimization of      polymorphic VNTR is essential to improve the discriminatory power of MLVA basis on  geographical region.