plasmid profile and enterobacterial repetitive intergenic consensus-pcr characterization of salmonella infantis isolates recovered from poultry sources

Background: salmonella is known as one of the most important bacterial agents infecting both humans and animals. salmonella infantis has been reported as one of the 15 most prevalent serovars worldwide. despite its clinical importance, there is little information on the molecular characteristics of s. infantis in iran. objectives: this study was conducted to characterize s. infantis isolates collected from poultry sources in the last decade. the isolates were typified by plasmid profile and enterobacterial repetitive intergenic consensus (eric-pcr). methods: forty s. infantis isolates from poultry sources were subjected to plasmid profile and eric-pcr characterization. we used a commercial plasmid extraction kit to extract and purify plasmid dna which then was separated by gel electrophoresis and viewed under a uv transilluminator. for eric-pcr, a commercial bacterial chromosomal dna extraction kit was used. in this study, we chose eric2 primer for the eric-pcr test. results: the plasmid profile revealed that 35% of isolates did not contain any plasmids, but the rest (65%) carried a variable number of plasmids with different molecular weights. six plasmid profiles were found among 40 s. infantis isolates. using eric2 primer, 7 profiles were found among 40 s. infantis isolates in eric-pcr. bands with molecular weights ranging from 400 to 3000 bp were observed.conclusion: this study provided some genetic data on s. infantis isolates recovered from poultry sources, and these data can be used for a broader epidemiological study nationwide. these findings showed that although plasmid and eric profiles are valuable in epidemiological studies, they have some limitations, too.

مطالعه خصوصیات جدایه‌های سالمونلا اینفنتیس بدست آمده از منابع طیوری با استفاده از تعیین الگوی پلاسمیدی و ERIC-PCR

زمینه مطالعه: سالمونلا به عنوان یکی از مهم‌‌ترین عوامل باکتریایی که هم انسان و هم حیوانات را آلوده می‌نماید، شناخته شده است. سالمونلا اینفنتیس به عنوان یکی از 15 سرووار شایع سالمونلا در سراسر جهان گزارش شده است. علیرغم اهمیت بالینی آن، اطلاعات محدودی مورد ویژگی های سالمونلا اینفنتیس در ایران موجود است.هدف: هدف از این مطالعه بیشتر دسته‌بندی نمودن سالمونلا اینفنتیس جدا شده از گله های مختلف در ایران در دهه گذشته با استفاده از تکنیک‌های تعیین محتوی پلاسمیدی و ERIC-PCR بود. روش کار:  تعداد 40 جدایه سالمونلا اینفنتیس، از منبع مختلف مرتبط با طیور در ایران،  با استفاده از تکنیک‌های تعیین محتوی پلاسمیدی و ERIC-PCR مورد مطالعه قرار گرفتند. یک کیت تجاری استخراج پلاسمید برای استخراج و خالص سازی پلاسمید از جدایه ها مورد استفاده قرار گرفت. سپس، پلاسمیدها با ژل الکتروفورز از هم جدا شدند و با اشعه ماوراء بنفش در یک دستگاه ترانس ایلومیناتور مشاهده شدند. برای انجام ERIC-PCR، کیت تجاری استخراج DNA کروموزومی مورد استفاده قرار گرفت.نتایج: از پرایمر ERIC2 برای ازمایش ERIC-PCR استفاده شد. تعیین محتوی پلاسمیدی جدایه ها مشخص نمود که 35% جدایه‌ها فاقد پلاسمید بودند و 65% بقیه دارای تعداد متنوعی پلاسمید در اوزان ملکولی متفاوت بودند. با استفاده از آغازگر ERIC2 تعداد هفت الگو در بین 40 جدایه سالمونلا اینفنتیس مورد آزمایش در ERIC-PCR مشاهده شد. باندهای با دامنه وزنی بین 400 تا 3000 جفت باز مشاهده شدند.نتیجه‌گیری نهایی: این مطالعه برخی از داده های ژنتیکی در مورد جدایه های سالمونلا اینفنتیس با منشاء طیوری را ارائه داده است. این داده‌ها را می توان برای یک مطالعه اپیدمیولوژیک گسترده تر در سراسر کشور مورد استفاده قرار داد. این یافته ها نشان داد که هر دو روش تعیین پروفایل پلاسمیدی و ERIC در مطالعات اپیدمیولوژیک با ارزش هستند، اما برخی از محدودیت ها را نیز دارا می‌باشند.