molecular detection and phylogenetic analysis of lumpy skin disease virus in iran

Background: lumpy skin disease (lsd) is a significant viral disease of cattle sometimes found in iran. objectives: the aim of this study was the molecular detection of lsd virus (lsdv) and the determination of their relationship with other iranian isolates. moreover, the origin and spread of these viruses were evaluated. methods: the lymph node samples taken from clinically affected cattle from the kurdistan province of iran were tested for lsdv using the polymerase chain reaction (pcr). results: the partial p32 gene of lsdv was detected by pcr, sequenced, and phylogenetically analyzed. the lsdvs detected in the present study were 42.98%-100% similar to other lsdvs of iran. conclusions: iranian lsdv isolates in this research had the highest similarity to the isolates found in the indian regions. however, they showed the lowest nucleotide identity with the countries located in the west and southwest of iran, namely turkey and saudi arabia lsdvs. it could be concluded that these viruses have entered iran from the eastern borders. it seems that the monitoring of the country borders should be taken into consideration. further studies should be carried out on lsdv pathogenesis and molecular epidemiology.

شناسایی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی ویروس بیماری لامپی اسکین (LSDV) در ایران

زمینه مطالعه: بیماری لامپی اسکین (LSD) یک بیماری مهم ویروسی در گاوها است که گاهی اوقات در ایران دیده می‌شود. هدف: هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی ویروس‌های بیماری لامپی اسکین و تعیین ارتباط آنها با سایر سویه‌های ایران، مبدا و محل گسترش آنها است. روش کار: در این مطالعه نمونه‌های غده‌های لمفاوی از گاوهایی که در استان کردستان به صورت بالینی درگیر بیماری بودند، اخذ شد. نمونه‌ها از نظر مولکولی و با روش PCR مورد بررسی قرار گرفتند. نمونه‌های مثبت مولکولی از نظر ژن P32 مورد مطالعه قرار گرفتند. سپس برای این نمونه‌ها سکانس و تعیین توالی صورت گرفت و آنالیزهای فیلوژنتیک انجام پذیرفت. نتایج: ویروس‌های LSD این مطالعه شباهت 42.98 تا 100 درصدی را با سایر جدایه‌های ایران نشان دادند. سویه‌های LSD این مطالعه بیشترین میزان شباهت را به سویه‌های هند داشتند. همچنین آنها کمترین شباهت را به سویه‌های کشورهای همسایه غرب و جنوب غرب ایران مانند ترکیه و عربستان سعودی داشتند. نتیجه‌گیری نهایی: این یافته نشان می‌دهد که احتمالا سویه‌های مورد مطالعه در این پژوهش از مرزهای شرقی وارد کشور شده‌اند. کنترل و مانتیورینگ منظم مرزها بایستی مورد تاکید قرار بگیرد. مطالعات بیشتری پیرامون پاتوژنز و اپیدمیولوژی مولکولی ویروس‌های LSD بایستی صورت پذیرد.