circulation of recently reported sub-genotype vii1.1 of newcastle disease virus in commercial and backyard chicken in north of iran

Background: newcastle disease virus (ndv) majorly infects the poultry, and despite high rates of vaccination, it is still circulating in different geographical regions. due to the high mortality rate, the economic loss of newcastle disease (nd) is enormous. objectives: the molecular characterization of ndv isolates from chicken farms in northern iran, during 2017-2018, was the main goal of this study.methods: we isolated and characterized five ndvs from commercial broiler and backyard chicken farms during severe disease outbreak. the partial coding sequence of fusion (f) genes of isolates was determined and compared with those of other published ndvs. results: phylogenetic analysis revealed that all of the isolates were grouped into sub-genotype vii.1.1 (formerly known as viil). all isolates carried multi‐basic amino acid residues at the cleavage site of fusion protein, typical of virulent strains. studied ndv isolates had high homology with the prevalent genotype ndv strains that currently circulate in china and republic of korea (96.94%). conclusions: our results suggested that ndv sub-genotype vii.1.1 (viil), circulating among chicken farms, may be a dominant sub-genotype. considering the genetic variation between the used vaccine strains (b1, lasota, and clone 30, all belonging to genotype ii) and circulating ndvs, it is recommended that a contemporary homologous virus should be developed as the vaccine strain to avert the outbreaks of genotype vii viruses.

چرخش تحت ژنوتیپ (VII.1.1 (VIIl اخیرا گزارش شده ویروس بیماری نیوکاسل در ماکیان صنعتی و بومی شمال ایران

زمینه مطالعه:  ویروس بیماری نیوکاسل یک عامل بیماری‌زای مهم در پرندگان است و علیرغم واکسیناسیون گسترده، هنوز در مناطق جغرافیایی مختلف چرخش می‌کند. به دلیل مرگ و میر بالا، خسارات اقتصادی ناشی از بیماری نیوکاسل، بسیار زیاد است. هدف: هدف از این مطالعه تعیین خصوصیات مولکولی جدایه‌های ویروس بیماری نیوکاسل در مزارع پرورش مرغ در شمال ایران، طی سالهای 20182017 بود.   روش کار: در زمان شیوع بیماری، پنج جدایه ویروس نیوکاسل از مزارع ماکیان گوشتی صنعتی و بومی جداسازی و شناسایی شدند. توالی بخشی از ژن‌های فیوژن جدایه‌ها تعیین شد و با سایر توالی‌های منتشرشده ویروس نیوکاسل مقایسه شد. نتایج: تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک نشان داد که همه جدایه‌ها در تحت ژنوتیپ VII.1.1 (VIIl) قرار دارند. در همه جدایه‌ها الگوی مولتی بازیک محل شکاف پروتئین F شبیه سویه‌های حاد نیوکاسل وجود داشت. جدایه‌های مطالعه‌شده شباهت زیادی (96.94٪) با سویه‌های نیوکاسل شایع در چین و جمهوری کره داشتند. نتیجه‌گیری نهایی: نتایج مطالعه پیشنهاد می‌کند که تحت ژنوتیپ VII.1.1 (VIIl) ویروس بیماری نیوکاسل در مزارع پرورش طیور منطقه در حال چرخش است و ممکن است تحت ژنوتیپ غالب باشد. با توجه به اختلاف ژنتیکی میان واکسن‌های مورد استفاده علیه بیماری (B1، لاسوتا و کلون30 که همگی متعلق به ژنوتیپ II هستند) و ویروس‌های نیوکاسل در حال چرخش در منطقه، توصیه می‌شود که برای جلوگیری از شیوع ویروس‌های ژنوتیپ VII.1.1 (VIIl) نیوکاسل از ویروس‌های همولوگ برای تولید واکسن استفاده شود.