genetic characterization of argas persicus from iran by sequencing of mitochondrial cytochrome oxidase i (cox1) and 16s rrna genes

Background: argas persicus has a great importance for health and veterinary, it can transmit many infectious agents such as borrelia anserina (avian spirochetosis) and aegyptianella pullorum. distinguishing argasidae due to close morphological relationship is difficult. objectives: in the present study, we performed molecular analyses based on pcr and sequencing of amplicon derived from 16s rrna and cox1 genes of a. persicus specimens in several provinces of iran. methods: out of seventy argas persicus collected and confirmed morphologically, eight ticks were chosen from five provinces of iran for gene analysis. their dna were extracted and amplificated using primers derived from 16 s ribosomal rna and cox1 genes using pcr. then the amplicons were sequenced and analyzed by chromas software and sequence alignment program (clustal w). phylogenetic analysis was also conducted using mega ver. 6.06 with a maximum-likelihood method. results: sequencing results indicated that all eight samples belonged to a. persicus species. their nucleotide sequencing revealed that the interspecific sequence differences of both genes (16s rrna genes and cox1) between our isolates were very infrequent. all isolates from different provinces were conserved across regions except for one isolate that exhibited a difference of only 1 nucleotide. within phylogenetic tree, a. persicus formed a clade with a. persicus from other regions of the world (south arica, italy, china, and south australia). conclusions: our findings suggested a very close phylogenetic relationship between a. persicus specimens obtained from different regions of iran.

خصوصیات ژنتیکی کنه آرگاس پرسیکوس ایران بر مبنای توالی ژن میتوکندریایی COX1 و16SrRNA

زمینه مطالعه: اهمیت آرگاس پرسیکوس در دامپزشکی و بهداشت است و توانایی انتقال بسیاری ازعوال عفونی مانند بورلیا آنسرینا (اسپیروکتوزیس ماکیان) و اجپتینلا پولروم را دارد، تشخیص ریخت شناسی در آرگاس به دلیل شباهت ظاهری دشوار است. هدف: این مطالعه تحلیل مولکولی بر اساس PCR دوژن COX1 و 16SrRNAوتحلیل توالی یاب محصول تکثیر آن‌ها در آرگاس پرسیکوس چند استان کشور ایران را مد نظر داشت. مواد و روش کار: از 70 مورد کنه آرگاس پرسیکوس جمع آوری شده که با ویژگی‌های ریخت شناسی تایید شدند، هشت کنه از پنج استان کشور برای تحلیل ژنی انتخاب شدند، DNA آن‌ها استخراج و با استفاده از پرایمرهای مشتق شده از دوژن COX1 و 16SrRNAتکثیر این دو ژن صورت گرفت ، محصول توالی یابی شد و بر اساس نرم افزار توالی یابی  کروماس و مرتب سازی توالی‌ها با نرم افزار (Clustal W) تجزیه وتحلیل فیلوژنتیکی آن با استفاده از برنامه MEGA ver. 6.06 با بیشترین اعتماد انجام شد. نتایج: نتایج تعیین توالی نشان داد که تمام هشت نمونه متعلق به گونه آرگاس پرسیکوس بودند. توالی‌های نوکلئوتیدی نشان داد که تفاوت‌های توالی بین دو ژن (ژن 16S rRNA و COX1) بین جدایه‌های ما بسیار نادر بود. تمام جدایه‌ها ازمناطق مختلف  استان‌های مختلف به جز یک جدایه از گیلان غرب استان کرمانشاه که تنها یک نوکلئوتید اختلاف داشت یکسان بودند، در آرگاس پرسیکوس گیلان غرب کرمانشاه با دیگر نقاط جهان مانند آفریقای جنوبی وآمریکا 1دراختلاف بود، آرگاس پرسیکوس ایران در درخت فیلوژنی در کلاد آفریقای جنوبی، ایتالیا، چین و جنوب استرالیا قرار دارد. نتیجه گیری نهایی: یافته‌های ما نشان می‌دهد که رابطه ی فیلوژنتیک بسیار نزدیکی بین نمونه‌های آرگاس پرسیکوس در مناطق مختلف ایران وجود دارد.