مکان یابی ژن‌های کنترل کننده صفات کمی (Qtls) پیوسته با خصوصیات راتون‌زایی در برنج

در گیاهان گرامینه پنجه زدن و تولید ساقه های ثانویه در صورت موجود بودن مواد غذائی و درجه حرارت مناسب یک صفت دائمی به حساب می آید. راتونینگ یا عملیات وارویش به صورت حفظ گیاه جهت رشد در فصل بعدی تعریف می گردد. در این تحقیق، به منظور شناسایی qtl های کنترل کننده صفات مرتبط با قابلیت راتون زایی از 80 لاین خویش آمیخته نوترکیب حاصل از تلاقی دو رقم هاشمی و نعمت استفاده شد. برای بررسی چند شکلی بین والدین از تعداد 500 نشانگر ریزماهواره استفاده شد که از این تعداد، 177 نشانگر چند شکل بودند که برای تهیه نقشه پیوستگی جمعیت روی لاین های خویش آمیخته نوترکیب مورد بررسی قرار گرفتند. نقشه پیوستگی بر اساس 170 نشانگر ریزماهواره ترسیم شد که 1590سانتی مورگان از ژنوم برنج را پوشش داد و فاصله متوسط بین نشانگرهای مجاور 9/3 سانتی مورگان بود. در مجموع چهارده qtl بر اساس روش مکان یابی فاصله ای مرکب فراگیر برای صفات تعداد خوشه بارور، وزن صددانه، باروری خوشه و عملکرد دانه راتون روی کروموزوم های 1، 3، 5، 6، 7 ، 8 و 11 شناسایی شدند. مقدار واریانس توجیهی توسط qtl های شناسایی شده برای صفات مورد ارزیابی از 7/69 تا 25/12 متغیر بود. برای هر کدام از صفات تعداد خوشه، وزن صد دانه و باروری خوشه در راتون یک qtl بزرگ اثر روی کروموزوم 1 به نام های qpfr1، qgwr1 و qfpr1 به ترتیب با 25، 24 و 23 درصد واریانس توجیهی قرار داشت. برای صفت عملکرد راتون بزرگ اثرترین qtl شناسایی شده روی کروموزم 6 به نام qyr6 باتوجیه 20 درصد از واریانس فنوتیپی این صفت قرار داشت. برای صفت وزن صد دانه qtl شناسایی شده روی کروموزوم 8 برای صفت عملکرد دانه راتون برای اولین بار در این تحقیق شناسایی شد.

Analysis of Quantitative Trait Loci for Ratooning Ability in Rils Population of Rice

Tillering and secondary stems in graminea plants are permanent characters, whereas there were being food matters and proper temperature for regeneration. Ratooning or regeneration phase is explained to remain of plant for growing in next season. Recombinant inbred lines (RILs) consisting of 80 lines, derived from a cross between Hashemi and Nemat were used to analyze the genetic basis ratooning ability of rice. Recombinant inbred lines were tested with 177 polymorphic microsatellite markers. Linkage map were constructed with 170 microsatellite markers and its total lengths was 1590 cM which the mean space between markers was 9.3 cM. Using of Inclusive composite interval mapping (ICIM) method, 14 QTLs were detected on chromosomes 1, 3, 5, 6, 7, 8 and 11 for the panicle number, hundred grain weight, fertility percentage and grain yield of ratoon. Among these mapped QTLs, qpfr1for panicle number, qgwr1 lrm; rlm; rlm;for hundred grain weight lrm;and qfpr1 lrm; for fertility percentage of ratoon lrm; lrm;, controlled 25.12 %, 23.46 % and 22.64 % of the phenotypic variance lrm; rlm;, rlm; lrm; respectively. lrm; The qyr6 lrm; rlm; rlm;was the major QTL for grain yield of ratoon on chromosome 6, controlled 19.95 % of the phenotypic variance lrm;. One new QTLs were identified for grain yield of ratoon which was located on chromosome 8.