شناسایی رونوشت‌های با افزایش تظاهر در رقم برنج (oryza sativa l.) مقاوم به تنش شوری با استفاده از تکنیک cdna-aflp

تنش شوری یکی از مهم ترین تنش های غیرزیستی برای برنج است که به طور منفی رشد و باروری آن را متاثر می سازد. در این پژوهش اثرات تنش شوری بر بیان افتراقی برخی از ژن های مسئول در تنش شوری در دو ژنوتیپ برنج متحمل و حساس به شوری (fl478 و ir29) با استفاده از تکنیک cdnaaflp مورد بررسی قرار گرفت. از میان tdfهای (transcript derived fragments یا قطعات حاصل از رونوشت ها) حاصل از 2 آنزیم برشی و 18 ترکیب آغازگری که در پاسخ به تنش شوری در رقم مقاوم در مقایسه با تیمار شاهد و حساس افزایش بیان نشان داده بودند 28 tdf جدا شد که در نهایت 21 عدد از آن ها کلون، توالی یابی و در بانک ژن ثبت گردیدند و سپس با استفاده از الگوریتم بلاست مورد آنالیز قرار گرفتند. tdfهای شناسایی شده در این مطالعه متعلق به گروه های متفاوتی از ژن ها شامل متابولیسم، ترارسانی سیگنال، فاکتورهای رونویسی، سمیت زدایی، سیستم ترانسپورت و دیگر مکانیسم های مرتبط با تنش شوری بودند که این امر بیانگر آن است که تعداد زیادی از فرآیندها در پاسخ به تنش شوری درگیر هستند. سپس تعدادی از این ژن ها برای تائید الگوهای بیانی به دست آمده توسط cdnaaflp با استفاده از آنالیز real time pcr انتخاب گردیدند که نتایج به دست آمده از این آزمایش الگوهای بیانی ردیابی شده با استفاده از تکنیک cdnaaflp را تائید نمود. نتایج این تحقیق نشان داد که cdnaaflp تکنیک قدرتمندی برای بررسی الگوی بیان ژن های برنج تحت تنش شوری می باشد. علاوه بر این یافته های ما به روشن نمودن اساس مولکولی اثرات تنش شوری بر ژنوم برنج و شناسایی ژن هایی که می توانند تحمل به شوری برنج را افزایش دهند کمک می نماید.