شناسایی رونوشت های با بیان افتراقی در گندم نان تحت تنش شوری با استفاده از تکنیک Cdna-Aflp

شوری یکی از مهمترین شرایط نامطلوب محیطی است که منجر به از بین رفتن بخشی از عملکرد گندم می شود. لذا شناخت ژن هایی با بیان افتراقی و آگاهی از عملکرد آنها در گندم برای افزایش مقاومت به شوری ضروری است. برای تعیین ژن های پاسخ دهنده به شوری، ترانسکریپتوم گندم شاهد و تحت تنش از طریق تکنیک cdnaaflp مورد ارزیابی قرار گرفت. بر مبنای مشاهدات ما، 31 قطعه حاصل از ترانسکریپت (tdf) با موفقیت توالی یابی شدند. بیشتر tdfهای شناخته شده به کمک جستجوی blastx، متعلق به ژن های درگیر در گروه های مختلف عملکردی مانند انتقال، تجزیه پروتئین، تنظیم رونویسی، انتقال سیگنال، دفاع سلول، انرژی و متابولیسم بودند. تکنیک pcr زمان واقعی نشان داد که بیان چهار tdf کم شد درحالیکه بیان 18 tpf افزایش یافت. به طور کلی، این یافته ها درک ما از مکانیسم های سلولی دخیل در پاسخ گندم به شوری خاک را ارتقاء بخشید. علاوه بر این، شناسایی ژن های جدید پاسخ دهنده به تنش شوری اطلاعات مفیدی برای کمک به بهبود تحمل گندم به این تنش را در مزرعه ارائه می دهد.

Identification of Differential Regulated Genes in Response to Salinity in Bread Wheat by using cDNA-AFLP Method

Salinity stress is one of the unfavorable environmental conditions leading to loss of yield in wheat. Therefore, the discovery of differentially activated transcripts and understanding of their role in the salinitytreated wheat are indispensable for improving salt resistance. To explore the salinityresponsive genes, we assayed transcripts from saltstressed and control wheat by using cDNAAFLP approach. Based our observations, 31 transcriptderived fragments (TDFs) were successfully sequenced. BLASTX search revealed that most of the TDFs were belonged to the genes responsible for metabolism and energy, cell defense, transcription control, transport, signal transduction, and protein degradation functional groups. Realtime polymerase chain reaction displayed that 18 TDFs upregulated and four downregulated under salinity. Overall, these findings can enhance our understanding on the molecular mechanisms of salt response in wheat. Besides, the identification of novel salinityresponsive genes can represent important information, which in turn, assists the improvement of wheat tolerance to this stress in the field.