تجزیه ارتباطی صفات آگروموفولوژیک در لاین‌های ذرت با استفاده از نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون Irap و Remap

ذرت (zea mays l.) یکی از مهم ترین محصولات غذایی در سراسر جهان بوده و به عنوان گیاه مدل برای مطالعه ژنتیک صفات مختلف استفاده می شود. شناسایی مکان های ژنی کنترل کننده صفات کمّی از موضوع های مهم حوزه ژنتیک و به نژادی است. در این مطالعه 100 لاین خالص ذرت از لحاظ صفات آگرومورفولوژیک (ارتفاع بوته، ارتفاع بوته تا اولین بلال، طول و عرض برگ، سطح برگ، شاخص سطح برگ، تعداد بلال، میزان کلروفیل، وزن دانه‌ در هر بوته، وزن چوب بلال، قطر ابتدای چوب بلال، قطر وسط چوب بلال، طول چوب بلال، وزن خشک بوته، تاریخ ظهور گل نر، تاریخ ظهور بلال اول و تاریخ ظهور بلال دوم) با طرح پایه کاملاً تصادفی با شش تکرار ارزیابی شدند. در آزمایش مولکولی پروفیل مولکولی لاین ها با هشت آغازگر نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون؛ irap و remap تهیه شد. هشت ترکیب آغازگر irap وremap 40 مکان ژنی را تکثیر کردند. از این 40 مکان، 38 مکان ژنی (95 درصد) چندشکلی نشان دادند. دامنه ‌pic در لاین‌های مورد مطالعه از 0/084 برای نشانگر ac/ds تا 0/383 برای نشانگر pangrangja متغیر بود. فاصله ژنتیکی نی بین لاین های تهیه شده از مشهد و کرمانشاه 0/053، کرج و مشهد 0/036، کرمانشاه و کرج 0/032 برآورد شد. در تجزیه ساختار جمعیت بر اساس نشانگرهای مولکولی، 100 لاین مورد مطالعه در دو زیر جمعیت (k=2) گروه بندی شدند. در تجزیه ارتباطی صفات اگرومورفولوژیک براساس دو روش glm و mlm به ترتیب 24 و 12 ارتباط نشانگرصفت شناسایی شد. در این تحقیق دو نشانگر مشترک heartbraker (480) در صفات قطر ابتدای چوب بلال و طول چوب بلال وubc878 × ruda در صفات تعداد بلال و وزن دانه هم با مدل خطی عمومی و هم با مدل خطی مخلوط شناسایی شد. نتایج بدست آمده از این مطالعه، اطلاعات ارزشمندی در زمینه گزینش به کمک نشانگر و مبنای ژنتیکی صفات مورد مطالعه ارائه می دهد که می‌توان از این اطلاعات در گزینش افراد طی برنامه‌های به نژادی و تولید ارقام جدید با میزان عملکرد بالا بهره برد.

Association Analysis of Agromorphological Traits in Maize Lines using Retrotransposon Based Markers IRAP and REMAP

Maize (Zea mays L.) is one of the most important food crops worldwide and is widely used as genetic research material for studying various traits. Identification of genetic loci controlling quantitative trait is an important subject in genetics and breeding programs. In the present study, 102 maize inbred lines was evaluated for agromorphological traits (plant height, plant height until first ear, leaf length, leaf width, leaf surface, leaf area indexear number, chlorophyll content, grain weight per plant, cob rsquo;s dry weight, cob rsquo;s diameter in first part, cob rsquo;s diameter in middle part, cob rsquo;s length, plant dry weight, days to tassel emergence, days to first ear emergence, days to second ear emergence) in completely randomized design with six replications. In the molecular experiment, 8 retrotransposonbased molecular markers primers was used for preparing the molecular profile of lines. Eight IRAP and REMAP primer combinations amplified 40 gene loci. Thirtyeight out of 40 loci (95%) showed polymorphism. The PIC values in the studied lines ranged from 0.084 for Ac/Ds to 0.383 for Pangrangja marker. The Nei rsquo;s genetic distance between lines prepared from Mashhad and Kermanshah was 0.053, between lines from Karaj and Mashhad was 0.036 and between lines from Kermanshah and Karaj was 0.032. In the analysis of population structure based on molecular markers, 102 studied lines were grouped into two subpopulations (K = 2). In the association analysis of agromorphological traits based on two GLM and MLM methods, 24 and 12 markertrait relationships were identified, respectively. In this study, two commons markers; Heartbraker (480) in cob rsquo;s diameter in first part and cob rsquo;s length and UBC878 × Ruda in ear number and grain weight per plant were identified with both general linear and mixed linear models. This information can be used in selecting individuals during tobacco breeding programs and developing varieties with high yield and performance.