|
|
|
|
بررسی نقش اپیژنتیکی lncrna در بیماران مبتلا به لنفومهای منتشر سلول های b
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
شهسواری میلاد ,اربابیان صدیقه ,حسینی فرزانه ,رضوی محمدرضا
|
|
منبع
|
زيست شناسي جانوري - 1403 - دوره : 17 - شماره : 1 - صفحه:29 -39
|
|
چکیده
|
لنفوم بزرگ سلول b منتشر (dlbcl) شایع ترین لنفوم است که حدود 25 تا 30 درصد از کل لنفوم های غیر هوچکین را تشکیل می دهد. درمان استاندارد dlbcl، رژیم r-chop است و باعث افزایش بقای پنج ساله کلی بیماران می شود، اما 30 تا 50 درصد از بیماران به این درمان پاسخ نمی دهند. اخیراً ترکیب جدید لنالیدومید به علاوه r-chop برای درمان dlbcl مورد بررسی قرار گرفته است. مطالعات اخیر بر تاثیر بالقوه تغییرات اپی ژنتیکی در بروز و توسعه اکثر سرطان ها و به ویژه dlbcl اشاره دارد. در این مطالعه، تغییرات بیان دو lncrna در بیماران مبتلا به dlbcl به صورت بیوانفورماتیکی بررسی شد و رابطه بین lncrna های hoxa transcript at the distal tip و plasmacytoma variant translocation 1 بررسی شده و تاثیر آنها بر مسیرهای سیگنالینگ مرتبط به دقت ارزیابی شده است. ما بیان نسبی دو lncrna را در سرطان dlbcl با استفاده از داده های tcga و gepia2 بررسی کردیم. سپس، پروتئین های هدف این lncrnaها را با استفاده از پایگاه داده rnainter.org شناسایی کردیم. در انتها، پروتئین هایی که با هر دو lncrna میان کنش دارند را با استفاده از نمودارهای venn نشان دادیم. در این مطالعه، میزان بیان lncrna در بیماران مبتلا به dlbcl به صورت بیوانفورماتیکی بررسی شد و نتایج نشان داد که در ژن های hoxa transcript at the distal tip و plasmacytoma variant translocation 1 افزایش بیان دیده شده است. این نتایج می توانند در تحقیقات مرتبط با بیان ژن ها و بررسی تغییرات مولکولی مفید باشند.
|
|
کلیدواژه
|
لنفوم، اپی ژنتیک، سرطان، dlbcl
|
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال, گروه زیستشناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال, گروه زیستشناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال, گروه میکروبیولوژی, ایران, انستیتو پاستور ایران, مرکز تحقیقات میکروبیولوژی, ایران
|
|
پست الکترونیکی
|
mrrazavi@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
investigating the epigenetic role of lncrnas in patients with diffuse b-cell lymphomas
|
|
|
|
|
Authors
|
shahsavari milad ,arbabian sedigheh ,hosseini farzaneh ,razavi mohamad reza
|
|
Abstract
|
diffuse large b-cell lymphoma (dlbcl) is a type of lymphoma that accounts for approximately 25-35% of all non-hodgkin's lymphomas. the standard treatment for dlbcl is the r-chop regimen, which increases the five-year overall survival of patients, but 30 -50% of patients do not respond to this therapy. recently, a novel combination of lenalidomide plus r-chop has been investigated for the treatment of dlbcl. recent studies have pointed to the potential impact of epigenetic changes in the occurrence and development of most cancers, especially dlbcl. in this study, the expression changes of two lncrnas in patients with dlbcl were bioinformatically investigated and the relationship between the lncrnas hoxa transcript at the distal tip and plasmacytoma variant translocation 1 was examined, and their impact on related signaling pathways was carefully evaluated. finally, we showed the proteins that interact with both lncrnas using venn diagrams. in this study, the expression level of lncrna in patients with dlbcl was bioinformatically analyzed and the results showed that the hoxa transcript at the distal tip and plasmacytoma variant translocation 1 genes were upregulated. these results can be useful in gene expression research and molecular alterations.
|
|
Keywords
|
lymphoma ,dlbcl ,epigenetics ,cancer
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|