مطالعه شبکه ژنی آنژیوژنز در جوجه‌های مرغ آرین حساس به آسیت با استفاده از داده‌های Rnaseq

سندروم آسیت یک عارضه متابولیکی است که در سنین بالا در پرندگان گوشتی بروز می‌کند و به سویه تجاری آرین که تنها لاین اصلاح شده مرغ گوشتی ایران می باشد آسیب جدی وارد کرده است. مطالعات گذشته نقش عوامل ژنتیکی در بروز این سندروم را اثبات کرده است. از آنجا که ارگان‌های متعددی در بروز آسیت دخالت دارند و نقش قلب در آنها از همه بارزتر است، از مطالعات ژنومی استفاده شد تا ژن‌های مرتبط با مسیر آنژیوژنز در هایپرتروفی بطن راست قلب شناسایی شوند. در این تحقیق تعداد 464 پرنده از خط پدری b لاین آرین تحت تنش سرمایی پرورش داده شد و در بررسی آنالیز داده هایrnaseq بین دو گروه سالم و مبتلا به آسیت، پروفایل بیان ژن‌ها در بطن راست قلب مرغان حساس و مقاوم به آسیت با استفاده از تکنولوژی توالی‌یابی نسل آینده مورد مقایسه قرار گرفت. نتایج بررسی ترنسکریپتومی ژنهای مسیر آنژیوژنز نشان داد که تعداد 59 ژن بین دو تیمار سالم و آسیتی تفاوت بیان معنی‌دار داشتند (p<0/05) که از این تعداد 29 ژن کاهش بیان نشان دادند. بر اساس نتایج هستی شناسی ژنی، بیشترین معنی داری در پروسه های بیولوژیکی به مسیرهای برهم کنش گیرنده های برون یاخته ای (ecm-receptors)، تقسیم سلولی میتوز، پارتیشن بندی کروموزومی، چرخه سلولی و اینترلوکین ها تعلق داشتند. بر اساس نتایج آنالیز شبکه از ژن های افزایش بیان یافته در بیماری آسیت، سه خوشه ژنی تشکیل شد که ژن هایی از قبیل ، col6a2، il7r، cdk1، به عنوان مهمترین ژن های مرتبط با آنژیوژنز معرفی شدند.