مقایسه کیفی و کمی نتایج مربوط به چند روش استخراج dna از ژنوم مایکوباکتریوم‌های بیماری‌زا و ساپروفیت

با توجه به اینکه نخستین مرحله جهت انجام آزمایش های مولکولی مانند واکنش زنجیره ای پلی مراز (polymerase chain reaction; pcr)داشتن dna کافی وباکیفیت می باشد، هدف ازانجام این مطالعه مقایسه پنج روش مختلف استخراج  dnaژنومی مایکوباکتریوم هابه منظور معرفی بهترین روش بود. بدین منظور از پرگنه های خالص مایکوباکتریوم اویوم پاراتوبرکلوزیس به عنوان مایکوباکتریوم بیماری زا و نیز سویه ای از یک مایکوباکتریوم ساپروفیت به نام مایکوباکتریوم فلئی استفاده شد. کمیت و کیفیتdnaهای به دست آمده توسط هریکاز روش ها، به ترتیب بر اساس غلظت dnaاستخراجی (نانوگرم در میکرولیتر) در طول موج 260 نانومتر و نیز بر مبنای نسبت od در طول موج های 260/280 با استفاده از دستگاه نانودراپ محاسبه و موردارزیابی قرارگرفت. استخراج dna از ژنوم مایکوباکتریوم هابااستفاده ازروش ctab (cetyltrimethylammonium bromide) بیشترین میزان و روش مبتنی بر جوشانیدن کمترین میزانdna را حاصل کرد. همچنین مقایسه میزان خلوصdna استخراج شده دراین روش ها نیزنشان داد که استخراج dna بااستفاده از روشctab بیشترین میزان وروش مبتنی بر جوشانیدن بازهم کمترین میزان خلوص راداشته است. همچنین بین دو نوع باکتری از نظر کیفیت dnaهای استخراج‌شده در هیچ یک از روش های استفاده شده برای استخراج dna اختلاف معنی داری وجود نداشت. با توجه به نتایج مطالعه حاضر به نظر می رسد که استفاده ازروش ctab یکی از مناسب ترین روش ها جهت استخراج dnaژنومیاز مایکوباکتریوم هاجهتتشخیص مولکولی آنها در نمونه های مختلف می باشد.