شناسایی آلل‌های خود ناسازگاری در ارقام بادام ایرانی به روش توالی‌یابی

شناسایی آلل‌های خودناسازگاری در ارقام بادام (prunus dulcis) اهمیت زیادی در احداث باغ‌های جدید و انتخاب والدین در برنامه‌های به‌نژادی بادام دارد. به منظور شناسایی آلل‌های جدید ناسازگاری در چند رقم بادام ایرانی، قطعات مربوط به هر آلل تکثیر و محصول pcr آن‌ها خالص‌سازی شد. برای همسانه‌سازی از ناقل pcr-blunt-ii-topo استفاده شد. ناقل به باکتری‌های مستعد escherichia coli top 10 منتقل و کلونی‌های تراریزش شده شناسایی شدند.dna پلاسمیدی استخراج و توالی‌یابی با استفاده از آغازگرهای m13 توسط دستگاه secugen انجام شد. نهایتاً توالی حاصل از این پلاسمیدها مقایسه و توالی ثابت مربوط به هر آلل با نرم‌افزار seqman ii تعییین شد. براساس نتایج این تحقیق، تعداد هشت آلل در ارقام بادام ایرانی شامل ارقام تجاری (s36)، هلویی (s37)، سفید (s38)، یزد-17 (s39 و s40)، مشهد 40 (s41)، جی-آر-16 (s42) و مامایی (s43) شناسایی شدند. هفت آلل از مجموع هشت آلل شناسایی شده، قبلا گزارش نشده است، ولی یکی از آلل‌ها (s40) شباهت زیادی با آلل ناسازگاری (s5) گزارش شده در گونه p. webbii داشت. شباهت بین آلل‌های خودناسازگاری در بادام اهلی با گونه وحشی p. webbii به وجود یک جد مشترک با گونه‌های جنس پرونوس و نقش این گونه در تکامل بادام‌های اهلی به عنوان یکی از اجداد اولیه اشاره دارد.