molecular detection and phylogenetic analysis of bovicola caprae in the west and northwest of iran based on cytochrome oxidase 1 marker

Lice are permanent, obligate ectoparasites for birds and mammals. bovicola caprae causes hypersensitivity, irritation, dermatitis, anemia, lower weight gain, and lower productivity in goats. this study was conducted to investigate b. caprae by molecular methods based on the mitochondrial genome in the west and northwest of iran. a total of 1017 samples of chewing lice collected from ten cities in five provinces were identified using diagnostic keys. after dna extraction and pcr, samples were sent for sequencing. morphological results were consistent with molecular examinations. nucleotide sequencing of samples isolated from different cities based on mitochondrial genome showed 100% intraspecific similarity. the sequences of b. caprae isolated in this study appeared in a branch next to the canadian and chinese samples in the phylogenetic tree with more than 90% similarity. the results of mitochondrial gene analysis in the present research showed that this fragment is useful for showing intraspecific similarity and species and genus differentiation of b. caprae.

تشخیص مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی بویکولا کاپره در غرب و شمال غرب ایران بر اساس نشانگر سیتوکروم اکسیداز 1

شپش ها انگل خارجی دائمی و اجباری پرندگان و پستاندارانند. شپش بویکولا کاپره، شپش جونده بز سبب ایجاد ازدیاد حساسیت، تحریک پذیری، درماتیت، کم خونی، کاهش وزن وکاهش تولید در بز می شود.این مطالعه به منظور مقایسه مولکولی بویکولا کاپره بر اساس ژنوم میتوکندریایی در غرب وشمال غرب ایران انجام شد. در مجموع 1017 نمونه شپش جونده بز از پنچ استان واقع در غرب و شمال غرب ایران جمع آوری شد و با استفاده از کلیدهای تشخیص تعیین هویت شدند. پس از استخراج  DNA و انجام واکنش PCR  نمونه ها برای تعیین توالی ارسال شدند. نتایج بررسی مورفولوژیک با بررسی های مولکولی مطابقت داشت. همردیف سازی توالی نوکلئوتیدی نمونه های جداسازی شده از  شهرهای مختلف بر اساس ژن سیتوکروم اکسیداز 1 تشابه درون گونه ای 100 درصد را نشان داد. در ترسیم درخت فیلوژنتیک توالی بویکولا کاپره جداسازی شده در این مطالعه در کنار نمونههای کانادا و چین در یک شاخه قرار  گرفتند که بر مبنای ماتریس شباهت بیش از 90 درصد قرابت فیلوژنتیک داشتند. نتایج تجزیه و تحلیل ژن سیتوکروم اکسیداز 1 در این مطالعه نشان داد که این قطعه برای نشان دادن شباهت درون گونه ایی،تمایز در سطح گونه و جنس بویکولا کاپره مفیداست.