|
|
|
|
molecular identification and phylogenetic analysis of pulex irritans in different regions of iran
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
seidy shahin ,tavassoli mousa ,malekifard farnaz
|
|
منبع
|
iranian journal of veterinary science and technology - 2021 - دوره : 13 - شماره : 2 - صفحه:46 -57
|
|
چکیده
|
The present study was conducted to perform a molecular comparison of pulex irritans based on the mitochondrial genome in four different climatic regions including the caspian sea region, a mountainous region, persian gulf region, and the central desert region, and based on nuclear ribosome genome in the west and northwestern iran. a total of 1937 adult flea samples were collected including 1019 p. irritans (52.61%) and 918 ctenocephalides canis (47.39%) from various hosts including humans (14.1%), sheep (22%), goats (33.5%), dogs (25.6%) and houses (6.7%) between april 2018 and may 2019. the samples collected from different hosts had similar morphological characteristics. however, there were slight differences based on mitochondrial markers and nuclear ribosomal markers in the study populations. the results from the phylogenetic tree based on three nuclear ribosome and mitochondrial markers showed that despite the slight differences in this sequence of different hosts and cities, all samples from different regions are in the same phylogeny. the results of ribosomal and mitochondrial genome analysis showed that these pieces are useful for demonstrating intraspecific similarity, and differentiation at species level and genus of p. irritans.
|
|
کلیدواژه
|
flea ,iran ,its1 ,its2 ,cox1 ,pulex irritans
|
|
آدرس
|
urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran, urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran, urmia university, faculty of veterinary medicine, department of pathobiology, iran
|
|
پست الکترونیکی
|
f.malekifard@urmia.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
تشخیص مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی کک پولکس ایریتانس در مناطق مختلف ایران
|
|
|
|
|
Authors
|
صیدی شهین ,توسلی موسی ,ملکی فرد فرناز
|
|
Abstract
|
کک انسان به عنوان یک انگل خارجی باعث ایجاد مشکلات بهداشتی جدی در سطح جهانی می شود. این مطالعه به منظور بررسی تنوع مولکولی پولکس ایریتانس (کک انسان) بر اساس ژنوم میتوکندریایی و هسته ایی در چهار منطقه مختلف ایران انجام شد. در این بررسی در مجموع 1019 کک پولکس ایریتانس جمع آوری گردید و تحت آنالیز مرفومتریک و مولکولی قرار گرفت. پس از استخراج DNAبا استفاده از پرایمرهای اختصاصی در توالی های ITS1، ITS2 و COX1 واکنشPCR انجام شد و 34 نمونه محصولPCR تعیین توالی گردید. تنوع درون گونه ایی در کک پولکس ایریتانس بر اساس نشارکر میتوکندریایی (COX1)ا0/15 درصد ارزیابی گردید. همردیف سازی توالی نوکلئوتیدی COX1 در مناطق مختلف تنها یک جابه جایی در اسید نوکلئوتید شماره 162 را نشان می دهد که در ایزوله همدان اسید نوکلوتید آدنین به جای اسید نوکلئوتید گوانین قرار می گیرد. براساس نشانگر هسته ای (ITS1) تنوع درون گونه در ده جمعیت 0/41 درصد دیده شد. توالی ITS1 دارای سه واحد تکراری و متوالی به طول 99bp بوده که از اسید نوکلئوتید های شماره 146، 246 و 332 شروع شدند. براساس تعیین توالی نوکلئوتیدی ITS2 هیچ تنوع مولکولی در ده جمعیت مورد مطالعه وجود نداشت. نتایج تجزیه و تحلیل ژنوم هسته ایی و میتوکندریایی نشان داد که این قطعات برای نشان دادن تنوع درون گونه ایی، تمایز در سطح گونه و جنس پولکس ایریتانس مفید هستند.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|