molecular identification and phylogenetic analysis of chlamydophila abortus isolated from sheep and goats

Chlamydophila abortus is one of the major causes of pregnancy failure (abortion) in sheep and goats in many countries. in the present study, milk samples from sheep and goat herds of west azerbaijan, iran were examined for c. abortus using pcr and nucleotide sequencing. a total number of 360 milk samples were randomly collected from sheep (n=180) and goats (n=180) of three different regions of west azerbaijan province during 2018. dna was isolated from samples and the nested-pcr was employed targeting the 16s rrna gene for detection of chlamydia spp. the omp gene was amplified and sequenced for the characterization of detected c. abortus.the results showed that 8.61% (95% ci: 6.13%–11.96%) of the examined samples (11.67% sheep and 5.56% goat milk samples) were positive for c. abortus. the frequency of positive samples in the central region was significantly higher than in other regions. positive samples for c. abortus from animals with a history of abortion were significantly higher than those without a history of abortion. positive samples in autumn were significantly higher than the other seasons and also, in animals more than four years old were significantly higher than other age groups. sheep infection was significantly higher than the goats. phylogenetic analysis based on the helicase gene showed that two sequenced isolates clustered closely with the other c. abortus isolates reported in the genbank. in conclusion, small ruminants in west azerbaijan province were contaminated with c. abortus and they could shed this organism into the milk.

شناسایی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیک کلامیدوفیلا آبورتوس جداشده از گوسفند و بز

کلامیدیوفیلا آبورتوس یکی از مهمترین عوامل ضعف آبستنی ) سقط جنین ( در گوسفند و بز در بیشتر کشورها است. در مطالعه حاضرنمونه های شیر گله های گوسفند و بز استان آدربایجان غربی برای تشخیص کلامیدیوفیلا آبورتوس با استفاده از روش واکنش زنجیرهای پلی مراز و توالی یابی نوکلئوتیدی مورد آزمایش قرار گرفت. تعداد 360 نمونه شیر بطور تصادفی از میش ها ) تعداد 180 نمونه ( وبزها )تعداد 180 نمونه( متعلق به 18 گله از مناطق مختلف استان آذربایجان غربی در طول سال 1397 اخذ گردید. اسید نوکلئیک نمونه16 جهت شناسایی گونه های کلامیدیا S rRNA های شیر جدا سازی شدند و روش واکنش زنجیره ای پلی مراز آشیانه ای برای ژن هدفپروتئین غشای بیرونی( آن جهت توصیف کلامیدیوفیلا آبورتوس تکثیر گردید و توالی یابی نوکلئوتید ( omp مورد استفاده قرار گرفت. ژنکل نمونه های مورد آزمایش از نظر کلامیدیوفیلا آبورتوس )CI: 6.13%–11.96% های آن انجام شد. نتایج نشان دادکه 8.61 درصد )% 95مثبت بودند. ) 11.67 درصد شیر گوسفند و 5.5 درصد شیر بزان (. 50 درصد گله های مورد ازمایش از نظر الودگی به کلامیدوفیلانمونه های .)p < ابورتوس مثبت بودند. میزان نمونه های مثبت در منطقه مرکزی استان بطور معنی داری از سایر مناطق بالاتر بود) 0.05p( مثبت کلامیدیایی در حیواناتی که سابقه سقط جنین داشتند بطور معنی دار بالاتر از مواردی بود که بدون سابقه سقط جنین بودندوهمچنین شیر حیواناتی که در .)p < 0.05 >(. نمونه های مثبت در فصل پاییز بطور معنی دار نسبت به سایر فصول بالاتر بود) 0.05انالیز فیلوژنتیکی بر .)p < گروه سنی بالای 4 سال بودند بطور معنی داری از سایر گروه های سنی موارد مثبت بالاتری داشتند) 0.05اساس ژن هلیکاز نشان داد که دو جدایه توالی یابی شده با سایر جدایه های گزارش شده در بانک ژنی قرابت نزدیک داشتند. نتیجهگیری اینکه نشخوارکنندگان کوچک در استان آدربایجان غربی با کلامیدیوفیلا آبورتوس الوده شده اند و آنها قادر به انتقال و ترشحاین باکتری به شیر می باشند و این مسئله هشدار جدی برای انتقال این ارگانیسم از شیر و محصولات لبنی به انسان می تواند باشد.