شناسایی روابط فیلوژنتیکی گندم زراعی و اجداد آن براساس توالی‌یابی ژن (HKT)

شوری یکی از مشکلات مهم در اراضی کشاورزی دنیا می‌باشد، به‌طوری‌که سالانه میلیون‌ها تن نمک از طریق آبیاری وارد خاک‌های زراعی می‌شود. گندم اولین و مهم‌ترین گیاه زراعی دنیا است که غذای اصلی بیش از یک سوم مردم جهان را تامین می‌کند. روش‌های نوین ژنتیکی هم‌چون توالی‌یابی امکان ارزیابی دقیق و سریع مواد ژنتیکی در سطح dna و rna را فراهم نموده است. ژن‌های hkt گروه مهمی از ژن‌ها در انتقال یون‌های سدیم و پتاسیم می‌باشند، بنابراین به‌منظور شناسایی تنوع آللی ژن hkt از گونه‌های زراعی و وحشی گندم استفاده شد. بذور در گلدان‌های پلاستیکی کشت شدند و در مرحله 3-2 برگی، dna به روش دویل و همکاران (1990) استخراج گردید. pcr با یک جفت آغازگر اختصاصی تکثیر و محصولاتpcr خالص‌سازی و توالی‌یابی شدند. نتایج، تنوع نوکلیوتیدی بین گونه‌های مورد بررسی و گندم نان موجود در ncbi را نشان داد. نتایج توالی‌یابی dna نشان داد که گونه آژیلوپس اسپلتوییدس با 9/98 درصد، بیش‌ترین شباهت و نمونه‌های گندم وحشی آژیلوپس کوداتا و آژیلوپس تریانسیالیس با 9/93 درصد کم‌ترین شباهت را در مقایسه با گندم نان ncbi نشان دادند، در حالی‌که هوردیوم اسپونتانیوم تنها 5/36 درصد، کم‌ترین شباهت را با توالی ncbi نشان داد. درخت‌های فیلوژنتیکی که براساس توالی dna با روش upgma ترسیم شدند، نتایج بالا را تایید نمود. همچنین روش‌های فیلوژنتیکی dna نشان می‌دهد که آژیلوپس اسپلتوییدس و گندم نان در یک زیرگروه قرار گرفته‌اند که نشان‌دهنده این است که ژن hkt از آژیلوپس اسپلتوییدس به واسطه الحاق وارد گندم نان شده است.