مطالعه برهمکنش بین پروتیین آمیلویید بتا با یون فلزی روی و نقش آن در بیماری آلزایمر

سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتیین آمیلویید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 amber و مدل حلال آب spc216 انجام گرفت. یافته ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و با کمک آنالیزهای مختلف دیگر (اعم از تحلیل ساختار دوم پروتیین، تعداد پیوندهای هیدروژنی و شعاع ژیراسیون) مشاهده کردیم که در حضور یون های فلزی روی، قبل و بعد از اتصال، ساختار پروتیین تفاوت چشم گیری خواهد کرد. نتیجه گیری: آنالیز داده های حاصل از تحلیل ساختار دوم پروتیین نشان می دهد که آمیلویید بتا پپتید در اثر اتصال با یون های روی، درصد بالایی از ساختار مارپیچی خود را از دست می دهد. با افزایش شعاع ژیراسیون بعد اتصال یون فلزی، پروتیین ساختار کروی خود را از دست داده و باز می شود. همچنین تعداد پیوندهای هیدروژنی در آمیلویید بتا پپتید، در حضور یون فلزی کمتر از در غیاب آن می باشد که تمامی این یافته ها دلیل محکمی بر پایداری کمتر ساختار پروتیین در حضور یون فلزی روی و تجزیه آن در مغز و ممانعت از رسوبدهی آمیلویید بتا پپتید و در نتیجه به تاخیر افتادن بیماری آلزایمر خواهد شد.واژگان کلیدی: آمیلویید بتا پپتید، بیماری آلزایمر، شبیه سازی دینامیک مولکولی، انحراف جذر مربع میانگین، تحلیل ساختار دوم پروتیین، شعاع ژیراسیون.