بررسی فراوانی ژنوتایپ سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس جدا شده از بیماران مسلول مراجعه کننده به انستیتو پاستور ایران

سابقه و هدف: بیماری سل به عنوان تهدیدی برای سلامت بهداشت جهانی مطرح است. بررسی اپیدمیولوژی بیماری سل میتواند در شناسایی منبع عفونت، سویه های غالب در حال گردش و دستیابی به مسیرهای انتقال در دنیا، نقش موثری داشته باشد. هدف از این مطالعه، تعیین ژنوتایپ سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بیماران مراجعه کننده به انستیتو پاستور ایران در سال های 13971396 بود. روش بررسی: در این مطالعه، 50 سویه تایید شده از نظر عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مورد بررسی قرار گرفتند. سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بعد از شناسایی و تعیین الگوی حساسیت دارویی با روش miruvntr (mycobacterial interspersed repetitive unit variable number tandem repeat)، تعیین ژنوتایپ شدند. یافته ها: ژنوتایپ های شناسایی شده cas/delhi (42%)، haarlem (%24)، new1 (%10)، lam (%8)، beijing (%8)،cameroon (%4)، eai (%2) و s (%2) تعیین شدند و سه کلونال کمپلکس و 44 سویه singleton شناسایی شدند. در سویه های مقاوم،ژنوتایپ beijing، ژنوتایپ غالب بود. هم چنین لوکوس های qub26 و qub4156 دارای بالاترین قدرت افتراق و تنوع آللی بودند.نتیجه گیری: ژنوتایپ cas/delhi وbeijing به ترتیب به عنوان ژنوتایپ های غالب در سویه های حساس به دارو و mdr معرفی شدند.

Evaluation of the prevalence of Mycobacterium tuberculosis strains isolated from tuberculosis patients referred to Pasteur Institute of Iran

Background: Tuberculosis is a threat to public health. The epidemiology of tuberculosis can be effective in identifying the source of infection, the dominant circulating strains and achieving transmission pathways in the world. The aim of this study was to determine the genotype of Mycobacterium tuberculosis (M. tb) strains in patients referred to Pasteur Institute of Iran between 2018 and 2019.Materials and methods: In this study, 50 confirmed M. tb strains were evaluated. After M. tb strains identification and determining the drug susceptibility test, all strains were genotyped by MIRUVNTR (Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Variable Number Tandem Repeat) method.Results: The most frequent genotype in all strains was CAS/Delhi (42%), followed by Haarlem (24%), NEW1 (10%), LAM (8%), Beijing (8%), Cameroon (4%), EAI (% 2) and S (2%). Three clonal complexes and 44 singleton isolates were identified. Beijing genotype was the common genotype in MDRTB strains. Also, QUB26 and QUB4156 loci had shown the highest of discriminative and allelic diversity.Conclusion: CAS/Delhi and Beijing genotypes were introduced as the dominant genotypes in drug sensitive and MDR strains, respectively.