مقایسه روش‌های استخراج ‏Dna‏ از بافت‌های ثابت شده در فرمالین

نقطه شروع‌ ‏بسیاری‌ از روش‌های‌ بیولوژی‌ مولکولی‌، ‏ضرورت‌ جداسازی dna‏ با کیفیت‌ عالی است. معمولا کیفیت dna‏ ‏با ‏عواملی‌ از قبیل‌ عدم‌ آلودگی‌ ناشی‌ ‏ازrna ‎، پروتیین، لیپید و سایر ساختارهایی‌ که‌ برای‌ آنزیم‌های‌ برشی‌ و ‏پلی‌ مرازها مزاحمت‌ ایجاد می‌کنند ‏سنجیده‌ می‌شود‎‏. معمولا dna ‏استخراج ‏شده‏ از بلوک های پارافین و بافت‌های فیکس شده در فرمالین بخاطر اثرات تخریبی وارد شده بر ‏dna، از کیفیت مطلوبی برخوردار نیستند. هدف از مطالعه، معرفی روش کارآمد در استخراج dna از بافت‌های نگهداری شده در فرمالین می‌باشد. جهت استخراج ‏dna‏ از بافت‌های نگهداری شده در فرمالین، دو پروتکل مختلف از کیت bioneer و کیت طراحی شده general genomic extraction ‏توسط نویسندگان مقاله مورد مقایسه قرار گرفتند. ارزیابی کمی و کیفی بر روی ‏dna‏ های استخراج شده انجام گرفت. جهت تایید و ارزیابی dna استخراج شده، واکنش ‏pcr‏ با پرایمرهای ژن بتاگلوبین بر روی تمام نمونه‌ها انجام شد.‏ نتایج آزمایش کیفی و کمی نشان داد که dna استخراج شده با استفاده از کیت general genomic extraction از کمیت و کیفیت مطلوبتری در مقایسه با کیت bioneer برخوردار بود. میزان تکثیر نمونه‌ها با پرایمر بتاگلوبین، حاکی از غلظت و خلوص بیشتر dna استخراج شده با کیت مذکور در مقایسه با کیت bioneer بود. با توجه به آسیب ناشی از نگهداری بافت در فرمالین، کیت general genomic extraction کارایی بیشتری در استخراج dna داشت. این روش می‌تواند برای استخراج ‏dna‏ از بافت‌های نگهداری شده در فرمالین و بلوک‌های پارافین به صورت روتین در آزمایشات تحقیقاتی و بالینی مورد استفاده قرار گیرد.