بررسی اثر تغییرات ژنتیکی در ژن هماگلوتینین ویروس های آنفلوانزا H9N2 در تشخیص آنها توسط RT-PCR

تغییرات ژنتیکی در ژن هماگلوتینین یک ویژگی مهم در ویروس های آنفلوانزا می‌باشد. این تغییرات ممکن است تشخیص تحت تیپ های آنفلوانزا با روش rt-pcr را با محدودیت مواجه نماید. در این مطالعه از 6 ویروس جدا شده از نای پرندگان صنعتی مشکوک به آنفلوانزا در استان خراسان شمالی، آزمایش rt-pcr جهت تشخیص آنفلوانزای گروه a بعمل آمد و هر 6 نمونه مثبت تشخیص داده شدند. سپس این جدایه ها با پرایمر اختصاصی h9n2 مورد آزمایش قرار گرفتند. نتایج نشان داد که چهار جدایه h9n2مثبت بوده و دو جدایه فاقد باند در ژل الکتروفورز بوده و منفی تشخیص داده شدند. جهت ارزیابی بیشتر، ژن کامل هماگلوتینین 6 ویروس جدا شده تعیین توالی شدند. با استفاده از نرم افزار blast بانک ژن، تمامی ویروس ها تحت تیپ h9n2 شناخته شدند. همچنین با مقایسه توالی پرایمرها با توالی هدف در ژن هماگلوتینین در دو ویروس آخر مشخص شد که سه اتصال غیر منطبق در انتهای 3'پرایمرهای جلویی و برگشتی وجود دارد که باعث کاهش حساسیت واکنش rt- pcrو کسب نتایج منفی کاذب شده است. بنابراین توصیه می‌گردد که آزمایشات rt-pcrدر یک دوره زمانی خاص به روز رسانی گردند.