ژنوتیپینگ استافیلوکوک‌های کواگولاز منفی جدا شده از نمونه‌های کلینیکی با استفاده از ژن tuf با تکنیک PCR-Sequencing

بیش از دو دهه از پیدایش استافیلوکک‌های کواگولاز منفی به عنوان پاتوژن‌های فرصت طلب بخصوص در افراد دارای نقص سیستم ایمنی و بیماران دارای ایمپلنت می‌گذرد. بروز فزاینده عفونت‌های بیمارستانی ناشی ازاین باکتری‌ها شناسایی آنها را در حد گونه مطرح می‌سازد. هدف از انجام این مطالعه شناسایی سویه‌های استافیلوکک کواگولاز منفی جداسازی شده از 50 نمونه کلینیکی به روش‌های فنوتیپی و سکانسینگ ژن tuf بود.تعداد 50 نمونه استافیلوکوک‌های کواگولازمنفی ازنمونه‌های مختلف بالینی بیمارستان شهید محمدی بندرعباس جداسازی شد. روش‌های فنوتیپی شامل آزمون‌های بیوشیمیایی و روش‌های ژنوتیپی سکونسینگ ژن tuf به کار گرفته شد. سپس بلاست و رسم درخت فیلوژنیک انجام شد.سویه‌هایی که از نمونه‌های بالینی جداسازی شدند شامل25(50%) استافیلوکک اپیدرمیدیس،22(44%) استافیلوکوک ساپروفیتیکوس و 3(6%) استافیلوکوک همولیتیکوس بودند. اغلب سویه‌های استافیلوکوک اپیدرمیدیس و استافیلوکوک ساپروفیتیکوس ازنمونه‌های خون و ادرارجداسازی شدند. وانکومایسین به عنوان موثرترین آنتی بیوتیک وسپس سفالکسین و افلوکساسیلین آنتی‌بیوتیک‌های موثر بودند. بعد از بلاستینگ سویه‌های رفرانس و ردیف نمودن آنها با 8 نمونه سکانس شده، درخت فیلوژنیک با روش neighbor joining رسم شد. 5 سویه دارای 100% قرابت نوکلیوتیدی با epidermidis strain semcv45 .s و 3 سویه دارای 99% قرابت با haemolyticus strain shlmcv14.s بودند.استافیلوکوک‌های کواگولاز منفی طیف وسیعی از عفونت‌های بیمارستانی را ایجاد می کنند. pcr-sequencing ژن tuf روش مناسب و مطمینی برای شناسایی سویه‌های استافیلوکوک کواگولاز منفی در مطالعات اپیدمیولوژیک است.