مقایسه‌ی روش‌های polymerase chain reaction (pcr) و loop-mediated isothermal amplification (lamp) برای تشخیص فاسیولا هپاتیکا در نمونه مدفوع جمعیت گوسفندی استان لرستان

یکی از بیماری های مشترک بین انسان و حیوان فاسیولیازیس می باشد. در ایران فاسیولازیس حیوانی تاریخچه ای طولانی داشته و همواره به عنوان یک مشکل مهم دامپزشکی مورد توجه بوده است. روش های مختلفی برای تشخیص آن استفاده می شود که یکی از این روش ها، روش lamp است. این مطالعه برای اولین بار به مقایسه ی روش های pcr و lamp برای تشخیص فاسیولا هپاتیکا در نمونه مدفوع جمعیت گوسفندی استان لرستان پرداخت. طی مدت 3 ماه، مجموعاً 195 نمونه مدفوع ازگوسفندان استان لرستان با روش تصادفی کلاسیک جمع آوری شد. نمونه‌های هر بخش جهت تکنیک lamp تا زمان استخراج dna در فریزر منفی 20 درجه نگهداری شدند. نمونه ها توسط روش های lamp و pcr بررسی شدند. داده‌های این مطالعه توسط روش کایاسکوار از نرم افزار spss نسخه 19، تحلیل شدند و ضریب کاپا برای توافق بین روش ها استفاده شد. نتایج نشان داد که تکنیک lamp اختلاف معنیداری با تکنیک pcr دارد و تکنیک lamp به شکل کارآمدتری عفونت با فاسیولا هپاتیکا را تشخیص داد (11 نمونه در روش lamp و 7 نمونه در روش pcr ). نتایج ضریب کاپا نشان داد که توافق معنی داری بین دو روش با ضریب 0.65 و ارزش معنی داری کمتر از 0.001 وجود دارد. همچنین روش lamp از حساسیت بیشتری برخوردار می باشد. در مجموع نتایج نشان داد که روش lamp از حساسیت و دقت بیشتری در مقایسه با روش pcr برخوردار بود و بنابراین این روش می تواند برای تشخیص فاسیولا هپاتیکا بعنوان یک روش کارآمدتر می تواند استفاده شود.

The comparison of polymerase chain reaction (PCR) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) methods for detecting Fasciola hepatica in faecal samples of sheeps in Lorestan province

Fascioliasis is a zoonotic disease with long history in Iran. Different methods are used for detection of the disease and one of methods is LAMP. The present study was conducted to compare the LAMP and PCR methods for detection of Fasciola hepatica in fecal samples of sheeps in Lorestan province. During 3 months, 195 samples were collected by classical randomized method. The samples were stored in 20ºC for future investigations by LAMP and PCR. The samples were investigated by LAMP and PCR. The data were analyzed by SPSS software and Chisquare and Kappa coefficient was used. The results showed that LAMP technique showed significant difference with LAMP and detected infected samples (11 samples in LAMP and 7 samples in PCR). The results for kappa showed a strong agreement between the both methods with coefficient of 0.65 and P=0.001). The LAMP method showed higher sensitivity. In sum, LAMP method showed higher sensitivity compared to other methods and can be used for detection of F. hepatica.