بررسی فراوانی اشریشیاکلی‌های انتروتوکسیژنیک و انتروپاتوژنیک در شیر و فرآورده‌های شیری خام به روش دوپلکس pcr

سویه های اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک معمولاً در کشورهای در حال توسعه شایع می‌باشند و علت اصلی اسهال در افرادی هستند که به کشورهای در حال توسعه مسافرت می کنند. تیپ های بیماریزای انتروپاتوژنیک (epec) به عنوان سویه هایی تعریف شده اند که دارای ژن eae هستند ولی ژن های 1stx  و2stx  را ندارند و می توانند علت اسهال در انسان و حیوانات باشند. هدف از این مطالعه شناسایی و بررسی میزان اشریشیا کلی جدا شده از نمونه شیر و فراورده های شیری خام با روش دوپلکس pcr بود. تعداد 102 نمونه شیر و فرآورده های شیری خام عرضه شده در بازار از بخش های مختلف استان آذربایجان شرقی انتخاب شدند. جدایه های اشریشیا کلی بعد از کشت و انجام تست های تاییدی شناسایی شدند. برای تشخیص سویه های اشریشیا کلی انتروتوکسیژنیک و انتروپاتوژنیک از دوپلکس pcr استفاده شد. به منظور شناسایی سویه های بیماریزای etec از پرایمر های مربوط به ژن های lt , st و برای شناسایی تیپ های بیماریزایepec از پرایمرهای مربوط به ژن های eae و  bfp استفاده شد. طبق نتایج بدست آمده، 45% نمونه ها آلوده به اشریشیا کلی بودند. در بین اشریشیا کلی های جدا شده هیچ مورد etec شناسایی نشد و  فقط دو مورد (4.34%) epec جداسازی شد که یک مورد (2.17%) آن epec تیپیک و یک مورد (2.17%) هم epec غیرتیپیک بود. باتوجه به مطالعات گذشته و مطالعه حاضر در ایران که نشان دهنده میزان بالای e. coli و حضور سویهepec در فرآورده های شیری خام است، می توان گفت که علت اصلی آن عدم رعایت شرایط صحیح بهداشتی، استفاده از شیر غیر پاستوریزه و انجام تمام مراحل تولید با دست و روش های سنتی می باشد.

Evaluation of the prevalence of enterotoxigenic and enteropathogenic Escherichia coli in raw milk and dairy products by DuplexPCR

Enterotoxigenic Escherichia coli is very important and usual, particularly in the developing countries and it is the main reason of diarrhea in travelers to developing countries. Enteropathogenic Escherichia coli strains are defined as intimincontaining diarrheagenic E. coli but do not produce Shiga toxin, which can cause diarrhea in humans and different animal species. Pathogenic Escherichia coli strains are commonly transmitted through contaminated food and water. The aim of this study was to identify Escherichia coli pathotypes in raw milk and dairy product samples using Duplex PCR. A total of 102 raw milk and dairy products samples were randomly collected from different localities in Western Azerbaijan and transferred in sterile conditions to department of food and drug microbiology lab, affiliated to Tabriz University of medical sciences. 46 E. coli were identified based on culture and a number of biochemical tests. Duplex PCR assay were developed for detection of enterotoxigenic and enteropathogenic Escherichia coli. The target genes selected for each category were the lt and st for ETEC, eae and bfp for EPEC isolates. According to the results, the rate of E. coli in samples was 45%. No ETEC strains were isolated from any of the samples examined and only 2 (4.34%) EPEC strains were identified. Previous studies and our results showed the high percentage of E. coli and EPEC in raw milk products.  It was concluded that using raw milk without pasteurization, and using traditional dairy products produced in unsanitary conditions and are the main resources for growth of E. coli pathotypes.