مقایسه ژنوتیپی جدایه‌های اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال جدا شده از ماکیان صنعتی ایران

اورنیتوباکتریوم رینوتراکئال (ort)، باکتری نوظهور بیماری زای تنفسی است که خسارات اقتصادی مهمی را در صنعت طیور ایجاد می‌کند.  مطالعات قبلی در ایران شباهت‌های مولکولی و ژنتیکی بالایی را بین جدایه‌های ort طی سال‌های 1999-2009، براساس sds-page، eric-pcr و تعیین توالی ژن 16s rrna نشان داد.  هدف از مطالعه حاضر تعیین ژنوتیپ جدایه‌های ort به دست آمده از ماکیان صنعتی با استفاده از روش‌های تکثیر تصادفی پلی‌مورفیسم dna (rapd) و تعیین تیپ توالی‌یابی چندجایگاهی (mlst) بود.  در این مطالعه، از 30 باکتری ort جدا شده از ماکیان صنعت طیور ایران در سال‌های 1379 تا 1395 تایید شده به‌روش بیوشیمیایی و مولکولی استفاده شد.  آزمایش rapd با استفاده از پرایمر opg11 بر روی تمام نمونه‌های ort مورد مطالعه انجام شد.  با توجه به نتایج آزمون rapd از بین 30 جدایه ort تنها 5 جدایه برای آزمون mlst انتخاب شدند که برای انجام آن، هفت جفت پرایمر برای تکثیر و توالی‌یابی ژن‌های خانه‌دار adk، aroe، fumc، gdha، mdh،pgi  و pmi طراحی گردید.  در آزمون rapd با استفاده از پرایمرopg11 ، تعداد 9 ژنوتیپ متفاوت مشاهده شد.  توالی dna الل‌های این هفت لوکوس، در خصوص هر 5 سویه ort، با توالی آلل‌های موجود در بانک اطلاعاتی mlst مقایسه شدند.  چهار ort از پنج جدایه مورد مطالعه متعلق به تیپ سکانسی 9 (st9) بودند و یک سویه هم تیپ سکانسی جدیدی بود.  بر اساس یافته‌های این مطالعه، یک تیپ سکانسی جدید از ort های طیور صنعتی در ایران گزارش گردید که پیش از این از سایر نقاط جهان گزارش نشده است.  مطالعات بعدی جهت بررسی تعداد بیش تری از جدایه‌های ort، می‌تواند در تشخیص تیپ‌های مختلف سکانسی و تیپ سکانسی غالب در کشور کمک‌کننده باشد.

genotypic comparison of ornithobacterium rhinotracheale isolates from commercial chickens of iran

ornithobacterium rhinotracheale (ort) is a newly emerging respiratory bacterial pathogen that causes significant economic losses to the poultry industry. previous studies in iran have shown high molecular and genetic similarity among ort isolates by sds-page, eric-pcr and 16srrna gene sequencing during 1999-2009. the aim of this study was the genotyping of ort isolates recovered from commercial chickens by using rapd-pcr with opg11 primer and multilocus sequence typing (mlst). in total, 30 ort isolates recovered from commercial chickens of iran during 2000-2017 and confirmed by bacteriological, biochemical and pcr tests were used in this study. all 30 ort isolates were subjected to rapd-pcr with opg11 primer. for mlst, 5 isolates were selected based on their rapd patterns. seven primer pairs were synthesized for amplification and sequenceing of seven housekeeping genes of adk, aroe, fumc, gdha, mdh, pgi and pmi in mlst assay. in rapd-pcr with opg11 primer, 9 different genotypes were found. the dna sequences of the distinct alleles of these seven loci of 5 ort strains were compared with other alleles deposited in genbank. four out of 5 strains belonged to sequence type 9 (st9) and one strain was found to be a new st.  based on the results of the present study, a new sequence type among ort isolates of iran was found that has not been previously reported from elsewhere in the world. further studies on more ort isolates may help in identification of different sequence types and dominat st in the country.