بررسی ارتباط چندشکلی اگزون 1 و اینترون 2 ژن آلفالاکتالبومین با صفات تولید شیر در گاومیش بومی استان آذربایجان شرقی با استفاده از تکنیک pcr-sscp

صفات تولید شیر و ترکیبات آن جز صفات کمی و چند ژنی می باشند و تحت تاثیر تعداد زیادی ژن قرار دارند.  این تحقیق به منظور تعیین چندشکلی ژن آلفالاکتالبومین و ارتباط آن با صفات تولید شیر در گاومیش بومی استان آذربایجان شرقی با استفاده از تکنیک pcr-sscp انجام شد.  بدین منظور از تعداد 150 راس گاومیش استان آذربایجان شرقی نمونه ی شیر تهیه و استخراج dna نمونه ها از شیر به روش پروناز صورت گرفت.  بعد از انجام مراحل استخراج dna، واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) جهت تکثیر یک قطعه 392 جفت بازی از اگزون 1 و اینترون 2 ژن آلفالاکتالبومین با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی انجام گرفت.  برای تعیین چندشکلی نمونه‌ها، الکتروفورز محصولات pcr پس از تک رشته شدن قطعات (روش چندشکلی فضایی رشته های منفرد مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلی مراز) و الکتروفورز روی ژل آکریلامید و رنگ‌آمیزی ژل به روش نیترات نقره انجام شد. الگوهای ژنوتیپی 1، 2 و 3 به ترتیب با فراوانی 5/87، 71/10، 78/1 مشاهده شد.  آنالیز آماری نشان داد بین ژنوتیپ ها و صفات تولید شیر، درصد پروتئین، درصد چربی و لاکتوز شیر ارتباط معنی دار وجود ندارد.  بر اساس نتایج این تحقیق انتخاب براساس چند شکلی ژن آلفالاکتالبومین نمی تواند در بهبود ژنتیکی صفات تولید و ترکیبات شیر در گاومیش های نژاد آذری موثر باشد.

Investigation of polymorphism of alphalactalbumin gene in exon 1 and intron 2 and its association with milk production traits in buffaloes of East Azarbaijan province by PCR‌–SSCP‌ technique.

Milk production traits and its components belong to quantitative and polygenic traits and affected by many genes. This study was conducted to determine the polymorphism in alphalactalbumin gene and its association with milk production traits using PCRSSCP method in Eastern Azarbaijan native buffaloes. Milk samples were collected from 150 buffaloes of Eastern Azarbaijan province and then DNA samples were extracted using pronase method. After DNA extraction specific primers used for amplification of 392 bp fragment of exon 1 and intron 2 alphalactalbumin gene. To identify the polymorphism, PCR products were electrophoresed on polyacrylamide gel (single strand conformation polymorphism method) and stained with silver nitrate method. The frequency of the 1, 2 and 3 genotypic patterns were 87.5%, 10.71% and 1.78% respectively. The statistical analysis indicated that the effect of genotypes on milk production, lactose, fat percentage and protein percentage had no significant effect. Based on current results, the analysis of alphalactalbumin gene polymorphism cannot be used for improving milk yield and composition of buffalo in Azari population.