تایپینگ جدایه های ایرانی پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی و طیور، بر اساس 4 ژن (l1-l4) بیوسنتز کننده هسته خارجی lps

پاستورلا مولتوسیدا یک پاتوژن گرم منفی است که موجب بیماری در حیوان و انسان می شود.  وبای مرغی و پاستوریولوز گوسفندی از عفونت های مهم پاستورلامولتوسیدا می باشد که ضرر و زیان های اقتصادی زیادی را به صنعت دامپروری وارد می سازد.  عوامل حدت مختلفی در این باکتری شناسایی شده اند که لیپوپلی ساکارید جزء مهم ترین فاکتورهای بیماری زای آن محسوب می شوند.  هدف از تایپینگ lps بررسی اختلاف سویه های پاستورلا مولتوسیدا بر اساس ژنتیک سنتز lps می باشد.  برای انجام تایپینگ مولکولی از کشت خالص هر جدایه با روش جوشاندن، استخراج dna ژنومی انجام شد و 32 جدایه پاستورلامولتوسیدای گوسفندی و 30 جدایه از طیور با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژنوتایپینگ لیپوپلی ساکاریدی به وسیله ی pcr، تعیین ژنوتیپ شدند.  سپس، توالی نوکلئوتیدی محصولات pcr از هر ژنوتیپ مشخص و ارتباط آن ها با توالی های موجود در بانک ژن مقایسه گردید.  نتایج نشان داد از 32 جدایه ی گوسفندی، 10 جدایه دارای ژنوتیپ l3 (31.25 درصد) بودند.  در جدایه های طیور نیز 18جدایه دارای ژنوتیپ l1 (60 درصد) و 4 جدایه دارای ژنوتیپ l2 (13.33 درصد) و 5 جدایه دارای ژنوتیپ l3 (16.66 درصد) و 2 جدایه دارای هر سه ژنوتیپ l1,l2,l3 (6.66 درصد) و 1 جدایه دارای دو ژنوتیپ l2, l3 (3.33 درصد) بودند.  از چهار ژنوتیپ لیپوپلی ساکارید پاستورلا مولتوسیدا، جدایه های گوسفندی تنها دارای ژنوتیپ l3 بودند ولی در مقابل، جدایه های طیور دارای ژنوتیپ های l3, l2, l1 بودند و هر دو میزبان فاقد ژنوتیپ l4 بودند.  این نتایج نشان می دهد که فراوانی و پراکندگی ژنوتیپ های lps بسته به نوع میزبان متفاوت می باشد.  در مقایسه نتایج توالی نوکلئوتیدی جدایه های بومی ایران با جدایه های موجود در بانک ژن یک اختلاف قابل توجه در ژنوتیپ l3 و به میزان کم تر در ژنوتیپ l1, l2 دیده شد.

Typing ovine and avian Pasteurella Multocida isolates from Iran based on LPS outer core biosynthesis loci (L1L4)

Pasteurella multocida is a negative gram pathogenic bacteria that causative agent of many diseases in animals and man. Fowl cholera and ovine pasteurellosis are of the most common infection of P. multocida that these diseases economic damage entered into the livestock industry. Different virulence factors of P. multocida have been introduced that LPS have an important role in virulence of the organism. The aim of LPS typing is determination differences between P. multocida strains based on LPS synthesis genetics. For perform molecular typing, DNA extraction was done with the using of a boiling method of each bacterial isolate culture and genotyping done on 32 ovine isolate and 30 avian isolates by PCR with using of specific primers for LPS genotyping experiment. The amplified LPS genes by PCR, then were sequenced and compared to the sequences deposited in the GenBank database from the world.  Of  the 32 ovine isolates only 10 isolates were contained L3 genotype (%31.25) and  of 30 avian isolates 18 isolates were contained L1 genotype (%60), 4 isolates contain L2 genotype (%13.32), 5 isolates contain L3 genotype (%16.66), 2 isolates contain all  three genotypes L1, L2, L3 (%6.66), 1 isolate contain both genotype L2, L3 (%3.33). Of the 4 genotypes, ovine isolates  were only contain L3 genotype in against, avian isolates were contained L1, L2, L3 genotypes that this was indicated the distribution of LPS genotypes is different based on host type. The sequencing results of Iranian isolates with GenBank isolates showed a significant difference in L3 genotype and less difference in L1, L2 genotypes.