ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه‌های عامل بیماری نوار قهوه‌ای برنج با استفاده از rep-PCR *

بیماری نوار قهوه‌ای برنج (brown stripe of rice) از خزانه‌های برنج (oryza sativa l.) استان مازندران گزارش و عامل آن(aaa) acidovorax avenae subsp. avenae شناسایی شده است (rahimian. 1986, iran agric. res. 5: 63-71). بررسی حاضر به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های به دست آمده از خزانه های برنج استان مازندران انجام گرفت. پس از کشت نمونه‌های دارای علایم نوار قهوه‌ای و بر اساس آزمون‌های بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی، جدایه‌ها به عنوان aaa شناسایی و برای بررسی ژنوتیپی به کار برده شدند. نتایج آزمون‌های اکسیداز، کاتالاز، هیدرولیز نشاسته، هیدرولیز کازیین و هیدرولیز تویین 80 مثبت بودند. جدایه‌ها از سوربیتول و مانیتول به عنوان منبع کربنی استفاده کرده ولی قادر به استفاده از سوکروز و سالیسین نبودند(rahimian. 1986, iran agric. res. 5: 63-71). dna ژنومی جدایه‌ها استخراج و انگشت نگاری dna با rep-pcr و با استفاده ازآغازگرهای box و rep طبق روش های توصیه شده و با اندکی تغییر انجام گردید ( versalovic et al. 1991, nucleic acids res. 19: 6823-6831 ). گروه بندی جدایه‌ها با مقایسه نقوش قطعات dna در ژل و نمره‌دهی بر پایه وجود یا عدم وجود قطعات همسان و با استفاده از ضریب تشابه جاکارد صورت گرفت. دندروگرام با روش مقایسه جفت‌ها از طریق میانگین‌های بی‌وزن (upgma) و با استفاده از نرم‌افزار ntsys 2.02 ترسیم گردید. مقایسه نقوش قطعات dna تکثیر شده درrep-pcr، نشان داد که در سطح تشابه 20، 50 و 80 درصد جدایه ها با آغازگر box به ترتیب به 7، 16 و 23 گروه و با آغازگر rep به ترتیب به 5، 13 و 19 گروه دسته‌بندی شدند. خوشه بندی به دست آمده با نقوش حاصل از rep-pcr مطابقت بالایی با خوشه بندی انجام گرفته با box-pcrداشت. پیش از این گزارشی در زمینه وجود سطح بالایی از تنوع ژنتیکی در جمعیت‌های این عامل باکتریایی در دست نبوده است.