شناسایی جدایه های *Brenneria nigrifluens

زخم پوستی گردوی ایرانی (juglans regia l.) با عامل brenneria nigrifluens سبب ایجاد شانکر در پوست تنه و شاخه های قطور (مسن) می شود. تشخیص دقیق و سریع بیماری، عامل مهمی در کنترل و کاهش خسارت بیماری است. در بررسی حاضر 59 جدایه باکتری از 114 نمونه دارای علایم زخم جمع آوری شده از استان های مازندران، گلستان، کرمان و کرمانشاه جداسازی شد. به علاوه 10 جدایه از استان فارس، یک جدایه از استان کهگیلویه و بویراحمد و یک جدایه از استان کردستان برای مقایسه با جدایه های جمع آوری شده به کار برده شد. جدایه ها براساس ویژگی های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی به دو گروه b. nigrifluens و گونه‌های نزدیک به آن تقسیم شدند. بررسی الگوی پروتیینی جدایه ها نیز این تقسیم بندی را تایید نمود. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی قطعه دی ان ا (dna) مورد انتظار به طول حدود 255 جفت باز در 24 جدایه b. nigrifluens تکثیر شد که pcr+ نامیده شدند. پس از گذشت هشت هفته از زمان مایه زنی نهال های گردو با جدایه های pcr+ لکه های آبسوخته و زخم پیش رونده ای روی سرشاخه ها ایجاد شد، در حالی که مایه زنی با جدایه های pcr¯ نتوانست علایم بیماری را روی سرشاخه های مایه‌زنی شده ایجاد کند. به منظور تعیین دقیق گونه جدایه ها و بررسی کارایی و فراگیری آغازگرهای اختصاصی استفاده شده، ناحیه 16s rdna یک جدایه pcr+ و سه جدایه pcr¯ تکثیر و تعیین ترادف شد، نتایج نشان داد که تنها ترادف 16s rdna جدایه pcr+ شباهت بالایی با گونهb. nigrifluens داشت. بر پایه نتایج تحقیق حاضر آزمون های متداول فنوتیپی به همراه انجام آزمون بیماری زایی و یا آزمون های تکمیلی مولکولی مانند واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای اختصاصی برای تشخیص قطعی b. nigrifluens ضروری است.