بررسی مولکولی و فیلوژنتیکی جدایه‌های جنس Rhizopus بر اساس منطقه ITS و مناطق D1-D2 از DNA ریبوزومی

سی و هفت جدایه از جنس rhizopus به دست آمده از میزبان‌های مختلف در استان‌های تهران، آذربایجان غربی، یزد و کردستان جهت مطالعات تاکسونومیکی مورد بررسی قرار گرفتند. منطقه its شامل ژن 5.8s و مناطق d1-d2 مربوط به dna ریبوزومی با استفاده از جفت آغازگرهای its1/nl4 تکثیر شدند. محصولات تکثیر شده توسط pcr با استفاده از آنزیم های برشی haeiii، rsai، hinfi و mspi مورد هضم آنزیمی قرار گرفتند و هفت جدایه نماینده، انتخاب شده و توالی یابی شدند. توالی های به دست آمده با 23 توالی از بانک ژن مقایسه شدند. براساس آنالیز فیلوژنتیک و محاسبه فاصله ژنتیکی جدایه‌های rhizopus در سه گروه قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده، سه گونه شناسایی شد: r. lyococcus، r. stolonifer var. stolonifer و r. oryzae. گونه r. lyococcus برای نخستین بار از ایران گزارش می‌شود. هر سه گونه شناسایی شده برای اولین بار از میزبان های هلو، شلیل، زردآلو، توت‌فرنگی، طالبی، خرمالو، آفتاب‌گردان و گوجه فرنگی از ایران جداسازی شده اند و گونه r. stolonifer var. stolonifer برای اولین بار از روی شلیل از دنیا گزارش می‌شود. در این تحقیق نشان داده شد که مناطق d2-d1 از بخش lsu در dna ریبوزومی نسبت به منطقه its در فیلوژنی این جنس مناسب‌تر است.