خالص‌سازی و تعیین ترادف نوکلیوتیدی ژنوم کامل ویروس موزاییک زرد کدو- جدایه فارس *‌

ویروس موزاییک زرد کدو (zucchini yellow mosaic virus) از نمونه های کدوی دارای علایم موزاییک، تاولی شدن و بدشکلی برگ و میوه و کاهش رشد از مزارع منطقه کفترک شیراز به کمک آزمون الیزا، جداسازی و یک نمونه به‌عنوان جدایه فارس این ویروس((zymv-f به منظور انجام مراحل بعدی تحقیق بررسی شد. zymv-f در شرایط گلخانه در کدو تکثیر و از بافت های آلوده برای خالص سازی فیزیکی ویروس استفاده شد. از آنتی سرم به‌دست آمده از آموده خالص ویروس، در آزمون های سرولوژیکی استفاده شد. با بهره گیری از روش به دام اندازی آر اِن اِی پیک و آغازگرهای اختصاصی طراحی شده، واکنش ترانویسی معکوس و زنجیره ای پلی مراز (rt-pcr) انجام شد و دی اِن اِی‌های تکثیر شده، همسانه‌سازی و تعیین ترادف شدند. با تجمیع ترادف های به‌دست آمده، ترادف کامل ژنوم zymv-f شامل 9591 نوکلیوتید (رس شمار jn183062 در بانک ژن) به‌دست آمد. آنالیزهای فیلوژنتیکی براساس ترادف نوکلیوتیدی و آمینو اسیدی ژنوم کامل و هر کدام از ژن ها به‌طور انفرادی نشان داد که zymv-f بیشترین شباهت را به جدایه های اسراییل و اسلواکی zymv دارد. هم‌چنین بر‌اساس ترادف قسمتی از ژن پروتیین پوششی، مشخص شد که جدایه های ویروس در ایران در سطح نوکلیوتیدی و آمینواسیدی شباهت زیادی به هم دارند و جدایه فارس و کرج در یک گروه قرار می گیرند. این اولین گزارش از تعیین ترادف کامل ژنوم zymv در ایران و دومین گزارش از منطقه خاور میانه و نزدیک است.