بررسی تنوع و تبارزایی جدایه‌های ویروس موزائیک خیار در ایران

ویروس موزاییک خیار(cucumber mosaic virus; cmv) عضوجنس cucumovirus از خانواده bromoviridae است. این ویروس در مقایسه به دیگر ویروس های گیاهی دارای وسیع ترین دامنه میزبانی بوده و در ایران از مناطق مختلف گزارش شده است. در این مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه‌های ایرانی این ویروس بر اساس ترادف همه ژنها بررسی و با ترادفهای همتا در جدایه‌های کشورهای دیگر مقایسه شده است. در این مطالعه ترادف کامل ژنوم دوجدایه از cmv از کدو(sqsh) و خربزه (mees) از استان‌های فارس و اصفهان گزارش شد. بررسی تبارزائی با هر سه آر ان ای و نیز با هر کدام از پنج ژن روی ژنوم cmv نیز نشان از قرابت بسیار نزدیک دو جدایه ی مذکور داشت. بررسی ترادفهای نوکلئوتیدی موجود نشان داد که اکثر جدایه‌های ایرانی که تاکنون تعیین ترادف شده‌اند به زیرگروه ia متعلق بودند هرچند براساس آر ان ای‌های 2 و 3 همگی یک نیای مشترک نداشتند. بر اساس نتایج این مطالعه تصور میشود که رخداد نوجوری (reassortment) از نوع iaiaib در ایجاد تنوع ژنتیکی جدایه‌های ایرانی نقش داشته باشد. ژن 1a کمترین تنوع و cp بیشترین تنوع را در جدایه‌های ایرانی زیرگروه i نشان دادند. احتمالا مهاجرت در فواصل دور و نیز نزدیک نقشی در تکامل و ساختار ژنتیکی cmv در جدایه‌های ایرانی داشته است.