بارکدگذاری dna برخی از گیاهان دارویی در شرق استان گلستان

روش بارکدگذاری dna ابزاری مفید برای شناسایی گونه‌های گیاهی و جانوری است. بارکدگذاری dna روش شناسایی گونه‌ها با استفاده از یک توالی کوتاه و استاندارد، از ژنوم است. در این تحقیق، از این روش به‌منظور شناسایی چهار گونه گیاهی از شرق استان گلستان شامل همیشه‌بهار (calendula persica c.a.mey.)، خارمریم (silybum marianum l.)، مرزه جنگلی (satureja mutica fisch.) و پنیرک معمولی (malva neglecta wallr.) استفاده شد. استخراج dna به روش ctab انجام و pcr با آغازگرهای طراحی شده براساس بارکدهای کلروپلاستی rbcl و trnh-psba و بارکد هسته‌ای its انجام شد. توالی‌های حاصل، با اطلاعات موجود در پایگاه اطلاعات ncbi تطبیق داده شد. نتایج نشان داد که هر سه بارکد به‌دلیل قدرت تفکیک بالا، تعداد snp پایین و جامعیت در اکثر گونه‌ها، بارکدهای بسیار مناسبی برای نمونه‌های مورد بررسی می‌باشند. همچنین، مقایسه‌ی بارکدهای گونه‌های جمع‌آوری شده از مراتع و عطاری‌ها نشان داد که برخی گونه‌های گیاهی که در عطاری‌ها عرضه می‌شوند، با گیاهی که مردم بومی از آن به‌عنوان دارو استفاده می‌کنند، متفاوت هستند. می‌توان گفت امکان اشتباه در ارائه گیاهان دارویی در عطاری‌ها غیر قابل انکار است. بنابراین بررسی سایر گونه‌های گیاهی موجود در عطاری‌ها به روش بارکدگذاری dna به‌عنوان امری ضروری پیشنهاد می‌شود.

DNA barcoding of some medicinal plants in eastern Golestan province

DNA barcoding technique is a useful tool for the identification of plant and animal species using a short and standard sequence of the genome. In the present study, this method was used to identify four plant species including Calendula persica C.A.Mey., Silybum marianum (L.) Gaertn., Satureja mutica Fisch. & C.A.Mey., and Malva neglecta Wallr. from the eastern Golestan province. The DNA was extracted by CTAB method and the PCR was performed with the primers designed based on the rbcL and trnHpsbA chloroplast barcodes and ITS nuclear barcode. The results of sequences were matched with the information in the NCBI database. The results showed that the all three barcodes were suitable for the samples studied due to their high resolution, low SNP number, and comprehensiveness in most species. Also, the barcodes comparison of the species collected from the rangelands and perfumeries showd that some plant species that are offered in the perfumeries are different from the plants that the natives use as medicine. It could be mentioned that the mistakes possibility in the medicinal plants offered in the perfumeries is undeniable. Therefore, the study on the other plant species in the perfumeries by the DNA barcoding method could be recommended as a necessity.