|
|
|
|
ارزیابی نشانگرهای مبتنی بر رتروترنسپوزون‌ها در شناسایی مکان‌های مرتبط با عملکرد و برخی صفات گیاهی در ژنوتیپ‌های کتان ایرانی (linum usitatissimum l.)
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
عباسی هولاسو حسین ,رحمانی فاطمه ,حسین زاده مینا ,حسن زاده قورت تپه عبدالله
|
|
منبع
|
تحقيقات گياهان دارويي و معطر ايران - 1399 - دوره : 36 - شماره : 5 - صفحه:851 -866
|
|
چکیده
|
با توجه به اینکه ارزش اقتصادی یک رقم به صفات مختلف آن بستگی دارد، بنابراین چگونگی اعمال انتخاب برای چندین صفت به‌منظور حصول حداکثر ارزش اقتصادی همواره مورد نظر به‌نژادگران بوده است. ازاین‌رو اطلاع دقیق از رفتار و ارتباط ژنتیکی این صفات به اصلاح ژنوتیپ‌ها کمک خواهد نمود. در این تحقیق، به‌منظور شناسایی نشانگرهای مولکولی مرتبط با 21 صفت زراعی، مورفولوژیک و فیزیولوژیک در 45 ژنوتیپ مختلف کتان (linum usitatissimum l.) براساس مدل خطی مخلوط، از 31 آغازگر مبتنی بر رتروترنسپوزون (12 آغازگر irap و 19 آغازگر remap) استفاده شد. مطالعه ساختار جمعیت به روش بیزین (bayesian) نشان داد که دو زیرگروه احتمالی (2=k) در جمعیت مورد مطالعه وجود دارد. با استفاده از مدل خطی مخلوط در مجموع 29 مکان مرتبط با 21 صفت مورد مطالعه (p ≤0.01) شناسایی شد. صفات وزن صد دانه و عملکرد دانه بیشترین تعداد مکان پیوسته را به خود اختصاص دادند. وجود نشانگرهای مشترک در میان برخی صفات بررسی شده مانند ارتباط معنی‌دار نشانگر ltr1ubc8082 با صفات ارتفاع بوته و وزن صد دانه و نشانگر ltr1-ubc807-4 با صفات وزن ساقه اصلی و تعداد کپسول ساقه اصلی می‌تواند ناشی از آثار پلیوتروپی و یا پیوستگی نواحی ژنومی دخیل در این صفات باشد. باوجوداین، نتایج این مطالعه می‌تواند با گنجاندن تعداد بیشتری از نشانگرهایی که با صفات مهم اقتصادی مرتبط هستند، تقویت شود.
|
|
کلیدواژه
|
ساختار جمعیت، عدم تعادل لینکاژی، عملکرد دانه، کتان (linum usitatissimum l.)، مدل خطی مخلوط
|
|
آدرس
|
دانشگاه تبریز, دانشکده کشاورزی, گروه به‌نژادی و بیوتکنولوژی, ایران, دانشگاه ارومیه, دانشکده علوم, گروه زیست‌شناسی, ایران, دانشگاه ارومیه, دانشکده علوم, گروه زیست‌شناسی, ایران, سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی, مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان آذربایجان‌غربی, بخش تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation of the retrotransposonbased markers in identifying the loci associated with yield and some plant characteristics in Iranian flax (Linum usitatissimum L.) genotypes
|
|
|
|
|
Authors
|
Abbasi Holasou H. ,Rahmani F. ,Hosseinzadeh M. ,Hassanzadeh Ghorttapeh A.
|
|
Abstract
|
Since the economic value of a cultivar depends on its different characteristics, thus procedure of selection for several traits to achieve maximum economic value has always been considered by plant breeders. Therefore, accurate knowledge of the behavior and genetic relationship of these traits will help breeders to improve plant genotypes. In this study, 31 retrotransposonbased primers (12 IRAP and 19 REMAP primers) were used to identify molecular markers associated with 21 agronomic, morphological, and physiological traits in 45 different flax (Linum usitatissimum L.) genotypes based on a mixed linear model (MLM). Analysis of population structure by Bayesian method revealed two possible subgroups (K=2) in the population studied. Using MLM, a total of 29 loci associated with the 21 traits studied were identified (p< /em><0.01). The maximum number of associated loci was identified for 100seed weight and seed yield traits. The existence of common markers among some traits studied, such as the significant relationship between LTR1UBC8082 marker with plant height and 100seed weight, and LTR1-UBC807-4 with main stem weight and the number of capsules per the main stem can be due to pleiotropic effects or linkage between genomic regions involved in these traits. However, findings of the present study can be further strengthened with the inclusion of more markers putatively associated with economically important traits.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|