کارایی نشانگرهای مولکولی rapd و scot در تمایز جمعیت‌های خارشتر (alhagi maurorum)

بررسی تنوع ژنتیکی اهمیت ویژه‌ای دردرک چگونگی ایجاد جمعیت‌ها در طول زمان و مکان‌های جغرافیایی دارند. در این تحقیق تنوع ژنتیکی 22 جمعیت خارشتر (alhagi maurorum) با استفاده از 27 آغازگر rapd و 24 آغازگر scot طی سال‌های 98-1397 مورد مطالعه قرار گرفت. از 27 آغازگر rapd، 19 و از 24 آغازگر scot، 18 آغازگر چندشکلی بالایی نشان دادند. در مجموع آغازگرهای rapd، 100 درصد چندشکلی و آغازگرهای scot، 95.42 درصد چندشکلی نشان دادند. بالاترین شاخص محتوای اطلاعات چندشکلی را آغازگرهای r3 و r11 (0.42) و s12 (0.44)، بالاترین شاخص نسبت چندشکلی (emr) را آغازگرهای r10 (17) و s2، s4،s6 ، s7 وs10 (13)، بالاترین شاخص نشانگری (mi) را آغازگرهای r13 (5.92) و s7 (5.36) و بالاترین شاخص قدرت تفکیک (rp) را آغازگرهای r4 (9.54) و s14 (11.7) به خود اختصاص دادند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که در هر دو نشانگر 14 درصد از تغییرات مربوط به بین گروه‌ها و 86 درصد مربوطه به درون گروه‌ها بود. تجزیه خوشه‌ای بر اساس داده‌های نشانگر rapd، جمعیت‌ها را در سه و بر اساس نشانگر scot، جمعیت‌ها را در شش خوشه گروه‌بندی نمود. بررسی خوشه‌ها نشان داد که تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیت نمی کند و پیشنهاد می شود که در مطالعات آتی از تلاقی بین جمعیت تهران با جمعیت‌های گناباد، طبس، بشرویه، سربیشه و نیلشهر که فاصله ژنتیکی بیشتری دارند، جهت ایجاد دورگ‌های برتر استفاده شود. کلیه پارامترهای ژنتیکی در هر دو نشانگر تقریبا برابر و بر این اساس کارایی هر دو نشانگر در مطالعه کنونی تقریباً یکسان بود.

efficiency of rapd and scot molecular markers in the differentiation of camelthorn (alhagi maurorum) populations

investigation of genetic diversity is particularly important in understanding how populations are created over time and geographical locations. in this study, the genetic diversity of 22 populations of alhagi maurorum was studied using rapd and scot primers during 2018-2019. from a total of 27 rapd and 24 scot primers, 19 and 18 primers showed high polymorphism, respectively. in overall, the rapd and scot primers showed 100% and 95.42% polymorphism, respectively. the r3, r11 (0.42), and s12 (0.44) primers had the highest polymorphism information content (pic) index, the r10 (17) and s2, s4, s6, s7 and, s10 (13) primers showed the highest effective multiple ratios (emr) index, the r13 (5.92) and s7 (5.36) primers had the highest marker index (mi) and, the r4 (9.54) and s14 (11.7) primers showed the highest resolving power (rp. the results of molecular variance analysis were similar and the both markers showed 14% and 86% of the variations between and within the groups, respectively. cluster analysis based on the rapd and scot markers, classified the populations into three and six clusters, respectively. the analysis of the clusters showed that there was no correlation between the genetic variation and geographical diversity. it was suggested that in future studies, crossing between tehran population and gonabad, tabas, beshroieh, sarbisheh, and nilshahr populations which have a greater genetic distance, could be effective to create superior hybrids.  in this study, all the genetic parameters of both markers were similar and their efficiency was almost the same.