|
|
|
|
تاثیر واکشت بر تنوع سوماکلونال کالوس بنگدانه (hyoscyamus niger) با استفاده از نشانگرهای issr
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
طهماسبی گوجگی سارا ,حق بین کمال الدین ,موسوی امیر ,پیری خسرو
|
|
منبع
|
تحقيقات ژنتيك و اصلاح گياهان مرتعي و جنگلي ايران - 1399 - دوره : 28 - شماره : 2 - صفحه:203 -211
|
|
چکیده
|
به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی در کشت درون شیشه‌ای دو نمونه کالوس گیاه دارویی بنگدانه (hyoscyamus niger) شامل کالوس جدید (یک ماهه) و کالوس قدیمی (یکساله) در مقابل برگهای تازه گیاه، از نشانگر تکرار توالی ساده (issr) استفاده شد. با استفاده از ده آغازگر 6.49 درصد چندشکلی در سه نمونه ذکرشده مشاهده شد. تجزیه وتحلیل واریانس مولکولی (amova) 68 درصد تنوع ژنتیکی را بین نمونه‌ها نشان داد. همچنین از ضرایب (ماتریس تشابه) جاکارد و دایس با روش های upgma و nj استفاده شد. بهترین دندروگرام برای نشان دادن تنوع ژنتیکی (دوری یا نزدیکی افراد)، استفاده از ضریب تشابه جاکارد بود. نتایج آنالیز خوشه‌ای نمونه‌ها را در دو گروه متفاوت گروه‌بندی کرد. این دسته‌بندی توسط تجزیه و تحلیل مولفه‌های اصلی (pcoa) نیز تایید شد. گروه اول شامل کالوس‌های قدیمی و گروه دوم شامل کالوس‌های جدید و برگهای گیاه بود. نتایج حکایت از این داشتند که تنوع سوماکلونال در کالوس های بنگدانه با افزایش تعداد دفعات واکشت افزایش می‌یابد.
|
|
کلیدواژه
|
آلکالوئیدهای پیرولیزیدین، ارزیابی ژنتیکی، تنوع سوماکلونال، jaccard، pcoa، nj
|
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, گروه علوم باغبانی و زراعی, ایران, پژوهشگاه ملی ژنتیک و زیست‌فناوری, پژوهشکده بیوتکنولوژی گیاهی, ایران, پژوهشگاه ملی ژنتیک و زیست‌فناوری, پژوهشکده بیوتکنولوژی گیاهی, ایران, دانشگاه بوعلی سینا همدان, دانشکده ژنتیک و به‌نژادی گیاهی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
The effect of subculture on somaclonal variation in callus culture of Hyoscyamus niger using ISSR markers
|
|
|
|
|
Authors
|
Tahmasebi Goojgi S. ,Haghbeen K. ,Mousavi A. ,Piri K.
|
|
Abstract
|
To evaluate the genetic variation in an in vitro culture of two samples of Hyoscyamus niger callus including new (onemonthold) and old (oneyearold) calli versus fresh leaves of the plant, the Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) marker was used. Using 10 primers, 6.49% polymorphism was observed in the three mentioned samples. Analysis of Molecular Variance (AMOVA) revealed 68% genetic variation among samples. Jaccard and Dice coefficients (similarity matrix) were also used by UPGMA and NJ methods. The best dendrogram to show genetic diversity (and distance or proximity of individuals) was known as the Jaccard similarity coefficient. The results of cluster analysis grouped the samples into two different groups. This classification was also confirmed by principal component analysis (PCoA). The first major group consisted of old calli and the second involved new calli and plant leaves. The result showed that the frequency of somaclonal variation in H. niger calli tended to increase with increasing the number of subculture times.
|
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|