|
|
|
|
بررسی تنوع ژنتیکی گیاه دارویی پنج‌انگشت (vitex agnuscastus l) بر اساس نشانگر مولکولی issr
|
|
|
|
|
|
|
|
نویسنده
|
سعیدیانی عبدالجبار ,بقایی فر زهرا ,فرشادفر محسن ,پورنقی پویا ,شیروانی هومن
|
|
منبع
|
تحقيقات ژنتيك و اصلاح گياهان مرتعي و جنگلي ايران - 1398 - دوره : 27 - شماره : 2 - صفحه:179 -192
|
|
چکیده
|
گیاه پنج‌انگشت یکی از مهمترین گیاهان دارویی است که نقش مهمی در سلامت زنان دارد. با توجه به تنوع بالا بین نمونه‌های این گیاه، تنوع ژنتیکی تعداد 19 ژنوتیپ با استفاده از 13 آغازگر issr بررسی شد. آغازگرهای issr درمجموع توانستند 74 باند تولید کنند که از این تعداد، 4 باند یک‌شکل و مابقی چند شکل بودند. میانگین درصد چندشکلی در بین ژنوتیپ های مورد بررسی برابر 95% بود که درصد چندشکلی برای آغازگرهای ubc824 (80%)، is14 (83%)، ubc851 (83%) و is11 (89%) و برای سایر آغازگرها برابر با 100% بود. در مجموع بر اساس کلیه شاخص‌ها، مناسب‌ترین آغازگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی پنج‌انگشت، آغازگرهای is16، is5 و ubc807 معرفی شدند. فاصله ژنتیکی ژنوتیپ های مورد بررسی با استفاده از ضریب دایس از 0.195 تا 0.593 متغیر بود. نتایج حاصل از دندروگرام تجزیه خوشه‌ای به روش upgma بر اساس ضرایب فاصله دایس، ژنوتیپ‌ها را در 3 گروه قرار داد. ژنوتیپ ها بر اساس روش تجزیه به مختصات اصلی اول و دوم پراکنش داده شدند که این دیاگرام با نتایج تجزیه خوشه ای کاملاً مطابقت داشت. همچنین نتایج حاصل از گروه بندی‌ها، با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی تایید شد.
|
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، نشانگر issr، گیاه دارویی، vitex
|
|
آدرس
|
دانشگاه پیام نور, ایران, دانشگاه پیام نور, گروه زیست‌شناسی, ایران, دانشگاه پیام نور, گروه کشاورزی, ایران, دانشگاه پیام نور, گروه زیست‌شناسی, ایران, دانشگاه پیام نور, گروه کشاورزی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetic Diversity Evaluation of (i)Vitex agnus castus based on ISSR Molecular Marker
|
|
|
|
|
Authors
|
Saedyani Abdul-Jabbar ,Baghaee Far Zahra ,Farshadfar Mohsen ,Pournaghi Pouya ,shirvani hooman
|
|
Abstract
|
Chaste tree (Vitex agnuscastus) is one of important medicinal plant that plays a key role in the women health. Due to high variation within the specimens of this plant, genetic diversity between 19 genotypes was investigated using 13 ISSR primers. The ISSR primers were able to produce a total of 74 bands, of which four were single bundle, and the rest were polymorphic. The mean of polymorphism percentage among the genotypes was 95%. The polymorphism rate observed for primers of UBC824 (80%), IS14 (83%), UBC851 (83%) and IS11 (89%) and for other primers were 100%. In total, based on all the indices, the most suitable primers for assessment of genetic diversity of Vitex agnuscastus were IS16, IS5, and UBC807. Genetic distance of the genotypes ranged from 0.195 to 0.593 using Dice coefficient. The results of cluster analysis using UPGMA method based on Dice coefficient, the genotypes classified into three groups. Based on the first and second coordinates, the distribution diagram of the genotypes were in agreement with the results of cluster analysis. The results of grouping was also confirmed the analysis of molecular variance.
|
|
Keywords
|
Vitex
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|