|
|
بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپ های جاشیر prangos ferulacea با استفاده از نشانگرهای مولکولی rapd و issr
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مرادی منصوره ,ایزانلو علی ,ضابط محمد
|
منبع
|
تحقيقات ژنتيك و اصلاح گياهان مرتعي و جنگلي ايران - 1398 - دوره : 27 - شماره : 2 - صفحه:165 -178
|
چکیده
|
جاشیر یک از اعضاء خانواده چتریان بوده و با توجه به اهمیت و تنوع این گیاه دارویی، حفاظتی، صنعتی و علوفه ای، بررسی تنوع ژنتیکی و تعیین قرابت گونه های مختلف آن امری بسیار ضروری است. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 19 اکوتیپ جاشیر جمع آوری شده از مناطق مختلف ایران با استفاده از نشانگرهای issr و rapd مورد بررسی قرار گرفت. تعداد پنج آغازگر issr و هشت آغازگر rapd برای بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ ها مورد استفاده قرار گرفت. آغازگرهای رپید در مجموع 44 نوار قابل امتیازدهی نشان دادند که 42 نوار چندشکلی داشتند. هفت نشانگر 100 درصد چندشکلی را نشان دادند. آغازگرهای issr استفاده شده، در مجموع 21 نوار قابل امتیازدهی ایجاد نمودند، که 18 نوار تشکیل شده چند شکلی نشان دادند. میانگین pic برای نشانگرهای rapd و issr به ترتیب 0.33و 0.304 برآورد گردید. میانگین تنوع ژنتیکی نی (h) برای نشانگر های rapd و issr به ترتیب 0.325 و 0.396 و شاخص اطلاعاتی شانون (i) برای نشانگر رپید 0.488 و برای نشانگر issr، 0.55 محاسبه شد. بر اساس اطلاعات بهدست آمده از تجزیه خوشهای اگرچه تنوع ژنتیکی بالایی بین اکوتیپ های مورد مطالعه وجود دارد، ولی نتایج تجزیه خوشه ای نشان داد که بین گروه های مشخص شده تنوع ژنتیکی با تنوع جغرافیایی مطابقت نداشته است. در مجموع مطالعات انجام شده بر روی اکوتیپ های جاشیر نشان داد که نشانگر مولکولی rapdو issr برای بررسی تنوع ژنتیکی جاشیر مناسب بوده و توانسته دامنه وسیعی از تنوع را نشان دهد.
|
کلیدواژه
|
جاشیر، جمعیت، چندشکلی، نشانگر مولکولی
|
آدرس
|
دانشگاه بیرجند, دانشکده کشاورزی, ایران, دانشگاه بیرجند, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران, دانشگاه بیرجند, دانشکده کشاورزی, گروه زراعت و اصلاح نباتات, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Evaluation of genetic diversity of Prangos ferulacea ecotypes using RAPD and ISSR molecular markers
|
|
|
Authors
|
Moradi Mansoureh ,Izanloo Ali ,Zabet Mohammad
|
Abstract
|
Prangos ferulacea L. is a member of the Apiaceae family. Considering the importance of this, industrial and forage plant, it is necessary to study the genetic diversity and determine the affinities of its different species. In this study, the genetic diversity of 19 ecotypes of Prangos ferulacea collected from different regions of Iran was investigated using ISSR and RAPD markers. Five ISSR and eight RAPD primers were used to investigate the genetic diversity of the ecotypes. The RAPD primers showed a total of 44 scoreable bands from which 42 bands were polymorphic. Seven RAPD primers revealed 100% polymorphism. Out of the 21 scoreable bands produced by the ISSR primers, 18 bands were polymorphic. The mean values of PIC for RAPD and ISSR markers were 0.330 and 0.304, respectively. The mean valus of Nei's genetic diversity (H) for RAPD and ISSR markers were 0.332 and 0.396, respectively, and Shannon's index (I) for RAPD and ISSR markers were 0.48 and 0.55, respectively. Based on the information obtained from cluster analysis using UPGMA method, the ecotypes were divided into eight groups for the data obtained from two marker systems. Although there was a high genetic diversity among the studied ecotypes, the results of cluster analysis showed that the genetic diversity did not correspond to the geographical variation among the identified groups. In general, studies on P. ferulacea ecotypes showed that the RAPD and ISSR molecular markers were suitable for investigating the genetic diversity of this species, and were able to indicate a wide range of genetic diversity.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|